Activity
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23 actions
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| Fetal anomalies v1.836 | PSAT1 | Arina Puzriakova Tag for-review was removed from gene: PSAT1. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.836 | PSAT1 | Arina Puzriakova commented on gene: PSAT1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.835 | PSAT1 |
Arina Puzriakova Source Expert Review Green was added to PSAT1. Rating Changed from Amber List (moderate evidence) to Green List (high evidence) |
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| Fetal anomalies v1.519 | PSAT1 | Arina Puzriakova Phenotypes for gene: PSAT1 were changed from Neu-Laxova syndrome 2, 616038; NEU-LAXOVA SYNDROME; PHOSPHOSERINE AMINOTRANSFERASE DEFICIENCY to Neu-Laxova syndrome 2, OMIM:616038; Neu-Laxova syndrome 2, MONDO:0014466 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.203 | PSAT1 | Rhiannon Mellis reviewed gene: PSAT1: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Neu-Laxova syndrome 2; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.88 | PSAT1 | Sarah Leigh commented on gene: PSAT1: There is enough evidence for this gene to be rated GREEN at the next major review. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.88 | PSAT1 | Sarah Leigh Deleted their comment | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.88 | PSAT1 | Sarah Leigh reviewed gene: PSAT1: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.88 | PSAT1 | Sarah Leigh Tag for-review tag was added to gene: PSAT1. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.86 | PSAT1 | Catherine Snow Classified gene: PSAT1 as Amber List (moderate evidence) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.86 | PSAT1 | Catherine Snow Added comment: Comment on list classification: Change from Green to Amber, as requested by NHSE for signed-off panel. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.86 | PSAT1 | Catherine Snow Gene: psat1 has been classified as Amber List (Moderate Evidence). | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.57 | PSAT1 | Rebecca Foulger Classified gene: PSAT1 as Green List (high evidence) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.57 | PSAT1 | Rebecca Foulger Added comment: Comment on list classification: Rated 'probable' for Neu-Laxova syndrome in Gene2Phenotype, but there are sufficient cases from the literature to support causation (6 families in PMID:25152457 and 1 Chinese family in PMID:31903955). Therefore updated rating from Amber to Green: Fetally-relevant phenotype and sufficient evidence. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.57 | PSAT1 | Rebecca Foulger Gene: psat1 has been classified as Green List (High Evidence). | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.56 | PSAT1 | Rebecca Foulger Phenotypes for gene: PSAT1 were changed from NEU-LAXOVA SYNDROME; PHOSPHOSERINE AMINOTRANSFERASE DEFICIENCY to Neu-Laxova syndrome 2, 616038; NEU-LAXOVA SYNDROME; PHOSPHOSERINE AMINOTRANSFERASE DEFICIENCY | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.55 | PSAT1 | Rebecca Foulger Publications for gene: PSAT1 were set to | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.54 | PSAT1 | Rebecca Foulger commented on gene: PSAT1: PMID:31903955 (Ni et al., 2019) report Chinese Neu-Laxova syndrome (NLS) patients from 2 families. Compound het PSAT1 variants R342W and Y70N were found in the proband from family 1. (PHGDH variants were identified in family 2). | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.54 | PSAT1 | Rebecca Foulger commented on gene: PSAT1: PMID:25152457. Acuna-Hidalgo et al., 2014 report a rare AR disorder with severe malformations leading to prenatal or early postnatal lethality (Neu-Laxova syndrome). They identified variants in PHGDH, PSAT1 and PSPH in individuals with NLS, including 6 families with 3 different missense and frameshift PSAT1 variants which segregated with the disease. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.0 | PSAT1 | Zornitza Stark reviewed gene: PSAT1: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: 25152457; Phenotypes: Neu-Laxova syndrome 2, MIM# 616038; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal; Current diagnostic: yes | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | PSAT1 | Rebecca Foulger reviewed gene: PSAT1: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.1 | PSAT1 | Rebecca Foulger Added phenotypes NEU-LAXOVA SYNDROME for gene: PSAT1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.1 | PSAT1 |
Rebecca Foulger gene: PSAT1 was added gene: PSAT1 was added to Fetal anomalies. Sources: PAGE DD-Gene2Phenotype,Expert Review Amber Mode of inheritance for gene: PSAT1 was set to BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal Phenotypes for gene: PSAT1 were set to PHOSPHOSERINE AMINOTRANSFERASE DEFICIENCY |
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