| Date | Panel | Item | Activity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Fetal anomalies v3.133 | MSTO1 | Sarah Leigh reviewed gene: MSTO1: Rating: ; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.124 | CNBP_CCTG | Sarah Leigh reviewed STR: CNBP_CCTG: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.121 | NSMF | Arina Puzriakova Mode of pathogenicity for gene: NSMF was changed from to Other | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.118 | ESAM | Achchuthan Shanmugasundram Phenotypes for gene: ESAM were changed from intracranial hemorrhage; cerebral anomalies to Neurodevelopmental disorder with intracranial hemorrhage, seizures, and spasticity, OMIM:620371 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.115 | ESAM | Achchuthan Shanmugasundram reviewed gene: ESAM: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: 36996813; Phenotypes: Neurodevelopmental disorder with intracranial hemorrhage, seizures, and spasticity, OMIM:620371; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.111 | ZMYM2 | Sarah Leigh reviewed gene: ZMYM2: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, imprinted status unknown | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.111 | WLS | Sarah Leigh reviewed gene: WLS: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.111 | UQCRFS1 | Sarah Leigh reviewed gene: UQCRFS1: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.111 | TK2 | Sarah Leigh reviewed gene: TK2: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.111 | SLC25A46 | Sarah Leigh reviewed gene: SLC25A46: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.111 | RMND1 | Sarah Leigh reviewed gene: RMND1: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.111 | RAB11A | Sarah Leigh reviewed gene: RAB11A: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, imprinted status unknown | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.111 | QRSL1 | Sarah Leigh reviewed gene: QRSL1: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.111 | PRKACB | Sarah Leigh reviewed gene: PRKACB: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, imprinted status unknown | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.111 | PRKACA | Sarah Leigh reviewed gene: PRKACA: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, NOT imprinted | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.111 | PNPLA8 | Sarah Leigh reviewed gene: PNPLA8: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.111 | PLXND1 | Sarah Leigh reviewed gene: PLXND1: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.111 | PET100 | Sarah Leigh reviewed gene: PET100: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.111 | PDHX | Sarah Leigh reviewed gene: PDHX: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.111 | PDHB | Sarah Leigh reviewed gene: PDHB: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.111 | PC | Sarah Leigh reviewed gene: PC: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.111 | NDUFS1 | Sarah Leigh reviewed gene: NDUFS1: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.111 | NDUFB3 | Sarah Leigh reviewed gene: NDUFB3: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.111 | NDUFB10 | Sarah Leigh reviewed gene: NDUFB10: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.111 | NDUFAF8 | Sarah Leigh reviewed gene: NDUFAF8: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.111 | NDUFA6 | Sarah Leigh reviewed gene: NDUFA6: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.111 | MYL9 | Sarah Leigh reviewed gene: MYL9: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.111 | MTFMT | Sarah Leigh reviewed gene: MTFMT: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.111 | MECOM | Sarah Leigh reviewed gene: MECOM: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, imprinted status unknown | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.111 | KIF21A | Sarah Leigh reviewed gene: KIF21A: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.111 | KDM5C | Sarah Leigh reviewed gene: KDM5C: Rating: ; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: X-LINKED: hemizygous mutation in males, monoallelic mutations in females may cause disease (may be less severe, later onset than males) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.111 | IBA57 | Sarah Leigh reviewed gene: IBA57: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.111 | GATB | Sarah Leigh reviewed gene: GATB: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.111 | ECHS1 | Sarah Leigh reviewed gene: ECHS1: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.111 | EARS2 | Sarah Leigh reviewed gene: EARS2: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.111 | DNA2 | Sarah Leigh reviewed gene: DNA2: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.111 | DARS2 | Sarah Leigh reviewed gene: DARS2: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.111 | COQ7 | Sarah Leigh reviewed gene: COQ7: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.111 | CLCN4 | Sarah Leigh reviewed gene: CLCN4: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: X-LINKED: hemizygous mutation in males, monoallelic mutations in females may cause disease (may be less severe, later onset than males) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.111 | CDX2 | Sarah Leigh reviewed gene: CDX2: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, NOT imprinted | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.111 | C1QBP | Sarah Leigh reviewed gene: C1QBP: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.111 | C19orf70 | Sarah Leigh reviewed gene: C19orf70: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.111 | ATP5O | Sarah Leigh reviewed gene: ATP5O: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.111 | AGTR1 | Sarah Leigh reviewed gene: AGTR1: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.111 | AARS2 | Sarah Leigh reviewed gene: AARS2: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.109 | NRXN2 | Dmitrijs Rots reviewed gene: NRXN2: Rating: RED; Mode of pathogenicity: None; Publications: PMID: 36923655; Phenotypes: ASD; Mode of inheritance: MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, NOT imprinted | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.86 | PRKACB |
Arina Puzriakova gene: PRKACB was added gene: PRKACB was added to Fetal anomalies. Sources: Expert Review Amber,Literature Q2_23_promote_green tags were added to gene: PRKACB. Mode of inheritance for gene: PRKACB was set to MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, imprinted status unknown Publications for gene: PRKACB were set to 33058759 Phenotypes for gene: PRKACB were set to Cardioacrofacial dysplasia 2, OMIM:619143 Penetrance for gene: PRKACB were set to unknown Mode of pathogenicity for gene: PRKACB was set to Loss-of-function variants (as defined in pop up message) DO NOT cause this phenotype - please provide details in the comments |
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| Fetal anomalies v3.8 | ZMYM2 | Stephanie Allen reviewed gene: ZMYM2: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: Neurodevelopmental-craniofacial syndrome with variable renal and cardiac abnormalities, OMIM:619522; Mode of inheritance: MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, imprinted status unknown | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.8 | LRIG2 | Stephanie Allen reviewed gene: LRIG2: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: Urofacial syndrome 2, OMIM:615112; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.8 | AGTR1 | Stephanie Allen reviewed gene: AGTR1: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: 16116425, 22095942; Phenotypes: Renal tubular dysgenesis, OMIM:267430; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.8 | CLCN4 | Stephanie Allen reviewed gene: CLCN4: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: Raynaud-Claes syndrome, OMIM:300114; Mode of inheritance: X-LINKED: hemizygous mutation in males, monoallelic mutations in females may cause disease (may be less severe, later onset than males) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.8 | MECOM | Stephanie Allen reviewed gene: MECOM: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: 29540340, 26581901; Phenotypes: Radioulnar synostosis with amegakaryocytic thrombocytopenia 2, OMIM:616738; Mode of inheritance: MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, imprinted status unknown | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.8 | WARS2 | Stephanie Allen reviewed gene: WARS2: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: 30920170, 28905505, 35074316, 29783990; Phenotypes: Neurodevelopmental disorder, mitochondrial, with abnormal movements and lactic acidosis, with or without seizures, OMIM:617710; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.8 | VARS2 | Stephanie Allen reviewed gene: VARS2: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: 33937156, 29314548, 29478218; Phenotypes: Combined oxidative phosphorylation deficiency 20, OMIM:615917; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.8 | UQCRFS1 | Stephanie Allen reviewed gene: UQCRFS1: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: 31883641; Phenotypes: Mitochondrial complex III deficiency, nuclear type 10, OMIM:618775; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.8 | UQCC2 | Stephanie Allen reviewed gene: UQCC2: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: 28804536, 24385928; Phenotypes: Mitochondrial complex III deficiency, nuclear type 7, OMIM:615824; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.8 | TXN2 | Stephanie Allen reviewed gene: TXN2: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: 26626369; Phenotypes: ?Combined oxidative phosphorylation deficiency 29 , OMIM:616811; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.8 | TRMU | Stephanie Allen reviewed gene: TRMU: Rating: RED; Mode of pathogenicity: ; Publications: 23625533; Phenotypes: Liver failure, transient infantile, OMIM:613070; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.8 | TRIT1 | Stephanie Allen reviewed gene: TRIT1: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: 32088416; Phenotypes: Combined oxidative phosphorylation deficiency 35, OMIM:617873; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.8 | TMEM65 | Stephanie Allen reviewed gene: TMEM65: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: 28295037; Phenotypes: TMEM65 related mitochondrial encephalopmyopathy; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.8 | TK2 | Stephanie Allen reviewed gene: TK2: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: Mitochondrial DNA depletion syndrome 2 (myopathic type), OMIM:609560; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.8 | SUCLA2 | Stephanie Allen reviewed gene: SUCLA2: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: 17287286; Phenotypes: Mitochondrial DNA depletion syndrome 5 (encephalomyopathic with or without methylmalonic aciduria), OMIM:612073; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.8 | SLC25A46 | Stephanie Allen reviewed gene: SLC25A46: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: 28653766, 35012485, 27543974, 26951855; Phenotypes: Pontocerebellar hypoplasia, type 1E, OMIM:619303; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.8 | SLC25A1 | Stephanie Allen reviewed gene: SLC25A1: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: 23393310, 24687295, 25614306; Phenotypes: Combined D-2- and L-2-hydroxyglutaric aciduria, OMIM:615182; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.8 | SFXN4 | Stephanie Allen reviewed gene: SFXN4: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: 24119684; Phenotypes: Combined oxidative phosphorylation deficiency 18, OMIM:615578; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.8 | SDHD | Stephanie Allen reviewed gene: SDHD: Rating: RED; Mode of pathogenicity: ; Publications: 26008905; Phenotypes: Mitochondrial complex II deficiency, nuclear type 3, OMIM:619167; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.8 | RMND1 | Stephanie Allen reviewed gene: RMND1: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: 25604853, 27412952; Phenotypes: Combined oxidative phosphorylation deficiency 11, OMIM:614922; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.8 | QRSL1 | Stephanie Allen reviewed gene: QRSL1: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: 29440775, 30283131; Phenotypes: Combined oxidative phosphorylation deficiency 40, OMIM:618835; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.8 | POLG | Stephanie Allen reviewed gene: POLG: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: 29574624, 33579567, 8368248; Phenotypes: Mitochondrial recessive ataxia syndrome (includes SANDO and SCAE), OMIM:607459, Mitochondrial DNA depletion syndrome 4A (Alpers type), OMIM:203700, Mitochondrial DNA depletion syndrome 4B (MNGIE type), OMIM:613662; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.8 | PNPLA8 | Stephanie Allen reviewed gene: PNPLA8: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: 29681094, 34177434; Phenotypes: ?Mitochondrial myopathy with lactic acidosis, OMIM:251950; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.8 | PET100 | Stephanie Allen reviewed gene: PET100: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: 25293719; Phenotypes: Mitochondrial complex IV deficiency, nuclear type 12, OMIM:619055; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.8 | PDHX | Stephanie Allen reviewed gene: PDHX: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: 20002125, 34873726; Phenotypes: Lacticacidemia due to PDX1 deficiency, OMIM:245349; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.8 | PDHB | Stephanie Allen reviewed gene: PDHB: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: 26865159; Phenotypes: Pyruvate dehydrogenase E1-beta deficiency, OMIM:614111; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.8 | PC | Stephanie Allen reviewed gene: PC: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: 30870574, 29752808, 34485016, 10323732; Phenotypes: Pyruvate carboxylase deficiency, OMIM:266150; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.8 | NDUFV2 | Stephanie Allen reviewed gene: NDUFV2: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: 26008862; Phenotypes: Mitochondrial complex I deficiency, nuclear type 7, OMIM:618229; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.8 | NDUFS1 | Stephanie Allen reviewed gene: NDUFS1: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: 20382551, 31557978; Phenotypes: Mitochondrial complex I deficiency, nuclear type 5, OMIM:618226; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.8 | NDUFC2 | Stephanie Allen reviewed gene: NDUFC2: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: 32969598; Phenotypes: Mitochondrial complex I deficiency, nuclear type 36, OMIM:619170; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.8 | NDUFB7 | Stephanie Allen reviewed gene: NDUFB7: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: 33502047; Phenotypes: ?Mitochondrial complex I deficiency, nuclear type 39, OMIM:620135; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.8 | NDUFB3 | Stephanie Allen reviewed gene: NDUFB3: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: 27091925, 22277967; Phenotypes: Mitochondrial complex I deficiency, nuclear type 25, OMIM:618246; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.8 | NDUFB11 | Stephanie Allen reviewed gene: NDUFB11: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: 25772934; Phenotypes: ?Mitochondrial complex I deficiency, nuclear type 30, OMIM:301021, Linear skin defects with multiple congenital anomalies 3, OMIM:300952; Mode of inheritance: X-LINKED: hemizygous mutation in males, monoallelic mutations in females may cause disease (may be less severe, later onset than males) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.8 | NDUFB10 | Stephanie Allen reviewed gene: NDUFB10: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: 31130284, 28040730; Phenotypes: Mitochondrial complex I deficiency, nuclear type 35, OMIM:619003; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.8 | NDUFAF8 | Stephanie Allen reviewed gene: NDUFAF8: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: 31866046; Phenotypes: Mitochondrial complex I deficiency, nuclear type 34, OMIM:618776; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.8 | NDUFA6 | Stephanie Allen reviewed gene: NDUFA6: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: 30245030; Phenotypes: Mitochondrial complex I deficiency, nuclear type 33, OMIM:618253; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.8 | NDUFA12 | Stephanie Allen reviewed gene: NDUFA12: Rating: RED; Mode of pathogenicity: ; Publications: 32341820, 35141356; Phenotypes: Mitochondrial complex I deficiency, nuclear type 23, OMIM:618244; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.8 | NADK2 | Stephanie Allen reviewed gene: NADK2: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: 27940755; Phenotypes: 2,4-dienoyl-CoA reductase deficiency, OMIM:616034; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.8 | MTPAP | Stephanie Allen reviewed gene: MTPAP: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: 31779033; Phenotypes: ?Spastic ataxia 4, autosomal recessive, OMIM:613672; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.8 | MTFMT | Stephanie Allen reviewed gene: MTFMT: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: 27393152, 30911575; Phenotypes: Combined oxidative phosphorylation deficiency 15, OMIM:614947, Mitochondrial complex I deficiency, nuclear type 27, OMIM:618248; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.8 | MRPS14 | Stephanie Allen reviewed gene: MRPS14: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: 30358850; Phenotypes: ?Combined oxidative phosphorylation deficiency 38, OMIM:618378; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.8 | MPC2 | Stephanie Allen reviewed gene: MPC2: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: 36417180; Phenotypes: Mitochondrial pyruvate carrier deficiency; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.8 | MPC1 | Stephanie Allen reviewed gene: MPC1: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: 34873722, 31145700; Phenotypes: Mitochondrial pyruvate carrier deficiency, OMIM:614741; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.8 | IBA57 | Stephanie Allen reviewed gene: IBA57: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: 23462291, 33890810; Phenotypes: Multiple mitochondrial dysfunctions syndrome 3, OMIM:615330; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.8 | GFM2 | Stephanie Allen reviewed gene: GFM2: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: 29075935, 26016410; Phenotypes: Combined oxidative phosphorylation deficiency 39, OMIM:618397; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.8 | GATB | Stephanie Allen reviewed gene: GATB: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: 30283131; Phenotypes: ?Combined oxidative phosphorylation deficiency 41, OMIM:618838; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.8 | ECHS1 | Stephanie Allen reviewed gene: ECHS1: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: 30918357, 26920905, 26000322; Phenotypes: Mitochondrial short-chain enoyl-CoA hydratase 1 deficiency, OMIM:616277; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.8 | EARS2 | Stephanie Allen reviewed gene: EARS2: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: 27571996, 31680123; Phenotypes: Combined oxidative phosphorylation deficiency 12, OMIM:614924; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.8 | DNA2 | Stephanie Allen reviewed gene: DNA2: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: 31045292, 24389050; Phenotypes: Seckel syndrome 8, OMIM:615807; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.8 | DGUOK | Stephanie Allen reviewed gene: DGUOK: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: 22868686; Phenotypes: Mitochondrial DNA depletion syndrome 3 (hepatocerebral type), OMIM:251880, Progressive external ophthalmoplegia with mitochondrial DNA deletions, autosomal recessive 4, OMIM:617070, Portal hypertension, noncirrhotic, 1, OMIM:617068; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.8 | DARS2 | Stephanie Allen reviewed gene: DARS2: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: 33977142; Phenotypes: Leukoencephalopathy with brain stem and spinal cord involvement and lactate elevation, OMIM:611105; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.8 | COX14 | Stephanie Allen reviewed gene: COX14: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: 22243966; Phenotypes: ?Mitochondrial complex IV deficiency, nuclear type 10 , OMIM:619053; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.8 | COQ7 | Stephanie Allen reviewed gene: COQ7: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: 26084283, 31240163; Phenotypes: ?Coenzyme Q10 deficiency, primary, 8, OMIM:616733; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.8 | COA6 | Stephanie Allen reviewed gene: COA6: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: 22277967, 25339201; Phenotypes: Mitochondrial complex IV deficiency, nuclear type 13, OMIM:616501; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.8 | C1QBP | Stephanie Allen reviewed gene: C1QBP: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: 33977026, 28942965; Phenotypes: Combined oxidative phosphorylation deficiency 33, OMIM:617713; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.8 | C19orf70 | Stephanie Allen reviewed gene: C19orf70: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: 27485409, 29618761; Phenotypes: Combined oxidative phosphorylation deficiency 37, OMIM:618329; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.8 | ATP5O | Stephanie Allen reviewed gene: ATP5O: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: 35621276; Phenotypes: Mitochondrial complex V (ATP synthase) deficiency; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.8 | AARS2 | Stephanie Allen reviewed gene: AARS2: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: 30819764, 28822227, 21549344; Phenotypes: Combined oxidative phosphorylation deficiency 8, OMIM:614096, Leukoencephalopathy, progressive, with ovarian failure, OMIM:615889; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v3.1 | AARS2 |
Patrick Campbell gene: AARS2 was added gene: AARS2 was added to Fetal anomalies. Sources: NHS GMS Mode of inheritance for gene: AARS2 was set to BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal Publications for gene: AARS2 were set to 30819764 Phenotypes for gene: AARS2 were set to fetal hydrops; polyhydramnios; pulmonary effusion; cardiomyopathy Penetrance for gene: AARS2 were set to Complete Mode of pathogenicity for gene: AARS2 was set to Other Review for gene: AARS2 was set to GREEN Added comment: This gene is not on R21. It can cause fetal phenotype and early neonatal death with bi-allelic variants. We had a fetus present locally with fetal hydrops from around 28 weeks. The result was discovered on whole genome sequencing after miscarriage (R14). It would not have been identified on R21 for fetal anomalies. The local finding of presentation antenatally is corroborated by recent publication (PMID 30819764) with a case showing polyhydramnios and nonimmune hydrops, with small pulmonary effusions and significant ascites first detected at 35 wk of pregnancy. Consideration should be given to adding the gene to R21. Sources: NHS GMS |
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| Fetal anomalies v2.10 | FOXP4 | Arina Puzriakova reviewed gene: FOXP4: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v2.10 | WBP11 | Arina Puzriakova reviewed gene: WBP11: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v2.10 | TMEM260 | Arina Puzriakova reviewed gene: TMEM260: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v2.10 | TLL1 | Arina Puzriakova reviewed gene: TLL1: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v2.10 | PLCB4 | Arina Puzriakova reviewed gene: PLCB4: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v2.10 | EHBP1L1 | Arina Puzriakova reviewed gene: EHBP1L1: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v2.1 | GRM1 | Zornitza Stark reviewed gene: GRM1: Rating: RED; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Spinocerebellar ataxia, autosomal recessive 13 MIM#614831; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.967 | SETD2 | Arina Puzriakova Mode of pathogenicity for gene: SETD2 was changed from to Loss-of-function variants (as defined in pop up message) DO NOT cause this phenotype - please provide details in the comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.964 | SETD2 | Rhiannon Mellis reviewed gene: SETD2: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: Loss-of-function variants (as defined in pop up message) DO NOT cause this phenotype - please provide details in the comments; Publications: PMID: 32710489, 33255631; Phenotypes: microcephaly, profound intellectual disability, congenital anomalies, dysmorphic facial features; Mode of inheritance: MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, NOT imprinted | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.920 | CACNA1D | Arina Puzriakova Mode of pathogenicity for gene: CACNA1D was changed from to Loss-of-function variants (as defined in pop up message) DO NOT cause this phenotype - please provide details in the comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.905 | WNT7B |
Arina Puzriakova Added comment: Comment on list classification: New gene added by Julia Baptista. There is sufficient evidence to promote this gene to Green at the next GMS panel update. Three families reported with fetuses with multiple congenital anomalies (PMID: 35790350). Biallelic variants were identified in probands of two families and parents in third family were both heterozygous for a variant found in one of the other families. Although the fetus was not available for testing, the genotype can be inferred as homozygous for the variant given the consistent phenotype between cases. Supportive zebrafish model supports pathogenicity. |
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| Fetal anomalies v1.902 | RAB11A | Eleanor Williams Added comment: Comment on mode of pathogenicity: All missense variants but no functional data available. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.902 | RAB11A | Eleanor Williams Mode of pathogenicity for gene: RAB11A was changed from to Other | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.900 | EDA | Rhiannon Mellis reviewed gene: EDA: Rating: RED; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.900 | DEPDC5 | Rhiannon Mellis reviewed gene: DEPDC5: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: None; Publications: PMID: 32848577; Phenotypes: Epilepsy, Structural brain malformations; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.900 | ACVRL1 | Rhiannon Mellis reviewed gene: ACVRL1: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: None; Publications: PMID: 27381467, 32170914; Phenotypes: Telangiectasia, hereditary hemorrhagic, type 2; Mode of inheritance: MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, NOT imprinted | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.900 | TK2 | Rhiannon Mellis reviewed gene: TK2: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Mitochondrial DNA depletion syndrome 2; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.900 | NUP88 | Rhiannon Mellis reviewed gene: NUP88: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: None; Publications: PMID: 33060286; Phenotypes: fetal akinesia; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.900 | CACNA1D | Rhiannon Mellis reviewed gene: CACNA1D: Rating: ; Mode of pathogenicity: Loss-of-function variants (as defined in pop up message) DO NOT cause this phenotype - please provide details in the comments; Publications: PMID: 32410215; Phenotypes: PRIMARY ALDOSTERONISM, SEIZURES, AND NEUROLOGIC ABNORMALITIES; Mode of inheritance: MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, NOT imprinted | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.900 | NONO | Rhiannon Mellis reviewed gene: NONO: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: None; Publications: PMID: 31680349; Phenotypes: ; Mode of inheritance: X-LINKED: hemizygous mutation in males, biallelic mutations in females | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.900 | FOXP2 | Rhiannon Mellis reviewed gene: FOXP2: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: None; Publications: PMID: 28976722; Phenotypes: Speech-language disorder, structural abnormalities of basal ganglia; Mode of inheritance: MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, NOT imprinted | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.900 | ASPH | Rhiannon Mellis reviewed gene: ASPH: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: None; Publications: PMID: 28976722; Phenotypes: ; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.900 | ST3GAL5 | Rhiannon Mellis reviewed gene: ST3GAL5: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: None; Publications: PMID: 28976722; Phenotypes: Infantile epilepsy; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.900 | MANBA | Rhiannon Mellis reviewed gene: MANBA: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: None; Publications: PMID: 33249554; Phenotypes: ; Mode of inheritance: None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.900 | C1QBP | Rhiannon Mellis reviewed gene: C1QBP: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: None; Publications: PMID: 32304219; Phenotypes: Combined oxidative phosphorylation deficiency 33, Cardiomyopathy, Myopathy, Metabolic acidosis, Ologohydramnios; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.880 | NDUFB11 | Rhiannon Mellis reviewed gene: NDUFB11: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: PMID: 25772934; Phenotypes: Linear skin defects, cardiomyopathy, ACC; Mode of inheritance: X-LINKED: hemizygous mutation in males, monoallelic mutations in females may cause disease (may be less severe, later onset than males) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.880 | TMEM70 | Rhiannon Mellis reviewed gene: TMEM70: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: PMID: 21147908, PMID: 24740313, PMID: 26550569, PMID: 20335238, PMID: 25326274; Phenotypes: IUGR, Oligohydramnios, Anhydramnios, Cardiomyopathy; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.880 | PLD1 | Rhiannon Mellis reviewed gene: PLD1: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: PMID: 33142350; Phenotypes: Cardiomyopathy, Congenital heart malformations; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.880 | NMNAT2 | Rhiannon Mellis reviewed gene: NMNAT2: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: None; Publications: PMID: 33442022; Phenotypes: Hydrops fetalis, brain malformation, oligohydramnios; Mode of inheritance: None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.880 | NEXN |
Rhiannon Mellis gene: NEXN was added gene: NEXN was added to Fetal anomalies. Sources: Literature,Expert Review Mode of inheritance for gene: NEXN was set to BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal Publications for gene: NEXN were set to PMID: 32058062; PMID: 33027564 Phenotypes for gene: NEXN were set to Cardiomyopathy Review for gene: NEXN was set to AMBER Added comment: This gene and phenotype were reviewed during a meeting on 21st July 2022 between representatives of the North Thames and Central & South R21 testing GLHs. Clinical review and curation was performed by Lyn Chitty, Alison Male, Rhiannon Mellis (North Thames GLH), and Stephanie Allen, Denise Williams, Esther Kinning and Anna de Burca (Central & South GLH). Outcome of review: Gene usually causes adult-onset AD cardiomyopathy. However, there may be a fetally relevant phenotype with biallelic variants. Support adding to the Fetal anomalies panel as an Amber gene, pending more evidence of fetal phenotype (only 2 reported unrelated cases to date). Currently rated Green on the following other PanelApp panel(s): Cardiomyopathy (dilated) Details of review: The fetal case in Sparks et al (PMID: 33027564) had pericardial effusion, ascites, cardiomegaly, dilation and hypertrophy of cardiac ventricles, hypoplastic and dysplastic aortic valve, diminished systolic function, fetal growth restriction, and was stillborn. 2 NEXN variants found in the fetus (1 mat inherited, 1 de novo) but unable to confirm phase. The fetal case in Rinaldi et al 2021 (PMID: 32058062) had Cardiomegaly, low contractility/outflow, fibroelastosis of right ventricle. The fetus was compound het for NEXN variants and parents were both unaffected het with normal echos. They'd had one previous pregnancy with same phenotype. Sources: Literature, Expert Review |
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| Fetal anomalies v1.880 | MED13L | Rhiannon Mellis reviewed gene: MED13L: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: PMID: 33142350, PMID: 32058062; Phenotypes: Intellectual disability, dysmorphic features, congenital heart malformations, talipes; Mode of inheritance: MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, NOT imprinted | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.863 | ACO2 | Sarah Leigh reviewed gene: ACO2: Rating: ; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: BOTH monoallelic and biallelic, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.860 | PLCB4 | Eleanor Williams reviewed gene: PLCB4: Rating: ; Mode of pathogenicity: None; Publications: 22560091, 23315542, 28328130, 23913798; Phenotypes: Auriculocondylar syndrome 2, OMIM:614669, auriculocondylar syndrome 2, MONDO:0013845; Mode of inheritance: BOTH monoallelic and biallelic, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.847 | PEX6 | Sarah Leigh edited their review of gene: PEX6: Added comment: For Peroxisome biogenesis disorder 4B (OMIM:614863), Falkenberg et al (PMID: 29220678) has identified Allelic Expression Imbalance (AEI) as a mechanism responsible for the condition. Affected patients (7 unrelated cases) were monoallelic for rs61753230 (c.2578C>T, p.Arg860Trp) and rs144286892 (c.∗442_445 delTAAA), with these variants being on the same chromosome (cis). It would appear that rs144286892 causes the over expression of the allele that it is on, resulting in over expression of rs61753230. The unaffected parents analysed were monoallelic for rs61753230 and biallelic for rs144286892, resulting in overexpression of both rs61753230 and wild type alleles (PMID: 29220678). Experimental evidence revealed that rs61753230 has a dominant-negative effect on the function of the PEX1- PEX6 complex in peroxisomal matrix protein import (PMID: 29220678).; Changed mode of pathogenicity: Other; Changed mode of inheritance: BOTH monoallelic and biallelic, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.844 | MYH6 | Ivone Leong reviewed gene: MYH6: Rating: ; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: BOTH monoallelic and biallelic, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.836 | CIT | Arina Puzriakova Tag for-review was removed from gene: CIT. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.836 | CIT | Arina Puzriakova commented on gene: CIT: The rating of this gene has been updated following NHS Genomic Medicine Service approval. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.835 | CIT |
Arina Puzriakova Source Expert Review Green was added to CIT. Rating Changed from Amber List (moderate evidence) to Green List (high evidence) |
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| Fetal anomalies v1.827 | RAC3 |
Rhiannon Mellis gene: RAC3 was added gene: RAC3 was added to Fetal anomalies. Sources: Literature,Expert Review,NHS GMS Mode of inheritance for gene: RAC3 was set to MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, NOT imprinted Publications for gene: RAC3 were set to 30293988; 29276006 Phenotypes for gene: RAC3 were set to Abnormality of brain morphology; Abnormal muscle tone; Neurodevelopmental delay; Intellectual disability Mode of pathogenicity for gene: RAC3 was set to Loss-of-function variants (as defined in pop up message) DO NOT cause this phenotype - please provide details in the comments Review for gene: RAC3 was set to GREEN Added comment: This gene already has sufficient evidence for Green rating on the ID panel (see below) and now adding evidence (from NHS GMS testing) for prenatal phenotype to support Green rating for the Fetal Anomalies panel also: A RAC3 likely pathogenic missense variant has been identified postnatally in a baby that presented prenatally with absent corpus callosum, bilateral ventriculomegaly, cerebellar and brainstem hypoplasia detected on fetal ultrasound and MRI. The variant is judged by the child's clinical team to be causative of the clinical and radiological features in the child. Copied from Green review on Intellectual Disability panel by Konstantinos Varvagiannis: PMID: 30293988 reports on 5 individuals (from 4 different families) with de novo missense variants in RAC3. All individuals demonstrated structural anomalies on brain MRI (notably agenesis/dysgenesis of the corpus callosum, variable degrees of polymicrogyria and ventricular anomalies) as well as shared non-specific neurological features including abnormal muscular tone, global developmental delay and severe to profound intellectual disability. Feeding difficulties were observed in 4/5 patients. All variants reported are missense and are presumed to result in constitutive protein activation, as suggested by previous observations either in RAC3 [eg. the p.(Gln61Leu) mutation] or the highly homologous RAC1 and RAC2. According to the authors this is further supported by the fact that Rac3 -/- mice do not show a severe phenotype while missense variants are underrepresented in the ExAC database (z=1.97) as opposed to loss-of-function variants (pLI=0.04 / probability of loss-of-function intolerance). Of the 3 SNVs reported, 2 variants were in adjacent amino-acid positions [p.(Gln61Leu) and p.(Glu62Lys)]. The latter variant was found in 2 half-sibs born to different fathers, due to suspected maternal gonadal mosaicism (variant absent in all sequencing reads in the maternal DNA sample). The specific variant was also found in a further affected individual from an unrelated family. Finally, as the authors point out a further individual with de novo RAC3 missense variant [p.(Ala59Gly)] was reported previously in an individual with thin corpus callosum and global developmental delay, although the phenotype was felt to be more reminiscent of Robinow syndrome (PMID: 29276006). Sources: Literature, Expert Review, NHS GMS |
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| Fetal anomalies v1.819 | TAB2 | Zornitza Stark reviewed gene: TAB2: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: 34456334; Phenotypes: Mitral valve disease, cardiomyopathy, short stature and hypermobility, Rasopathy-like; Mode of inheritance: MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, NOT imprinted | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.819 | PHF6 | Ivone Leong reviewed gene: PHF6: Rating: ; Mode of pathogenicity: None; Publications: 24092917, 25099957; Phenotypes: ; Mode of inheritance: X-LINKED: hemizygous mutation in males, monoallelic mutations in females may cause disease (may be less severe, later onset than males) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.806 | DMPK | Arina Puzriakova Mode of pathogenicity for gene: DMPK was changed from to Loss-of-function variants (as defined in pop up message) DO NOT cause this phenotype - please provide details in the comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.800 | CNBP | Arina Puzriakova Mode of pathogenicity for gene: CNBP was changed from None to Loss-of-function variants (as defined in pop up message) DO NOT cause this phenotype - please provide details in the comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.792 | EDNRB | Ivone Leong reviewed gene: EDNRB: Rating: ; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.749 | RAB11A | Dmitrijs Rots reviewed gene: RAB11A: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: PMID: 33875846, 26902202; Phenotypes: microcephaly, brain anomalies, intellectual disability; Mode of inheritance: MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, NOT imprinted | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.749 | EXOC3L2 | Rhiannon Mellis reviewed gene: EXOC3L2: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: 30327448, 28749478, 27894351; Phenotypes: Dandy Walker malformation, Meckel-Gruber like phenotype; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.749 | SMARCE1 | Rhiannon Mellis reviewed gene: SMARCE1: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: PMID: 32732226, 32436246, 32410215; Phenotypes: Coffin Siris syndrome 5; Mode of inheritance: MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, NOT imprinted | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.749 | SMARCC1 | Rhiannon Mellis reviewed gene: SMARCC1: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: 32732226; Phenotypes: Congenital hydrocephalus, Aqueduct stenosis; Mode of inheritance: MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, NOT imprinted | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.749 | SLC6A9 | Rhiannon Mellis reviewed gene: SLC6A9: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: PMID: 31875334, 27773429, 32712301, 33269555; Phenotypes: Glycine encephalopathy with Arthrogryposis; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.749 | CRADD | Rhiannon Mellis reviewed gene: CRADD: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: PMID: 29947050, 27773430; Phenotypes: Mental retardation, autosomal recessive 34, with variant lissencephaly; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.749 | ENPP1 | Rhiannon Mellis reviewed gene: ENPP1: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: PMID: 31742715, 19521093, 19813208; Phenotypes: Generalised arterial calcification of infancy (GACI); Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.749 | ACAN | Zornitza Stark reviewed gene: ACAN: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Spondyloepimetaphyseal dysplasia, aggrecan type, MIM# 612813; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.738 | IFT122 | Sarah Leigh reviewed gene: IFT122: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.736 | LRIT3 | Zornitza Stark reviewed gene: LRIT3: Rating: RED; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Night blindness, congenital stationary (complete), 1F, autosomal recessive 615058; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.736 | AAAS | Zornitza Stark reviewed gene: AAAS: Rating: ; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Achalasia-addisonianism-alacrimia syndrome, MIM#231550; Mode of inheritance: None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.720 | LONP1 | Zornitza Stark reviewed gene: LONP1: Rating: RED; Mode of pathogenicity: None; Publications: 34547244; Phenotypes: Congenital diaphragmatic hernia; Mode of inheritance: MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, NOT imprinted | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.720 | TMEM260 | Alistair Pagnamenta reviewed gene: TMEM260: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: PMID: 28318500, 34612517; Phenotypes: ventricular septal defects, truncus arteriosus, elevated creatinine levels; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.717 | GNB1 | Sarah Leigh Added comment: Comment on mode of pathogenicity: Gen2Phen entry for GNB1 (https://www.ebi.ac.uk/gene2phenotype/gfd?dbID=2121) lists the mutation consequence summary as Activating | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.717 | GNB1 | Sarah Leigh Mode of pathogenicity for gene: GNB1 was changed from to None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.712 | FGF8 | Zornitza Stark reviewed gene: FGF8: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: None; Publications: 34433009; Phenotypes: Femoral hypoplasia; Mode of inheritance: MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, NOT imprinted | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.702 | COL4A2 | Arina Puzriakova reviewed gene: COL4A2: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.702 | COL4A1 | Arina Puzriakova reviewed gene: COL4A1: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.679 | DMPK | Dmitrijs Rots reviewed gene: DMPK: Rating: RED; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, NOT imprinted | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.674 | PRKD1 | Zornitza Stark reviewed gene: PRKD1: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: 27479907, 32817298, 25713110, 33919081; Phenotypes: Congenital heart defects and ectodermal dysplasia, 617364, Congenital heart disease, autosomal recessive; Mode of inheritance: BOTH monoallelic and biallelic, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.674 | SPTBN5 | Zornitza Stark reviewed gene: SPTBN5: Rating: RED; Mode of pathogenicity: None; Publications: 28007035; Phenotypes: Sacral agenesis; Mode of inheritance: MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, NOT imprinted | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.674 | WDR91 | Zornitza Stark reviewed gene: WDR91: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: None; Publications: 34028500, 28860274; Phenotypes: ; Mode of inheritance: None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.658 | FKBP8 |
Arina Puzriakova Added comment: Comment on list classification: Additional publication identified by Rhiannon Mellis (GOSH) describing a fetus with severe thoracolumbar scoliosis and caudal spinal cord agenesis and a homozygous (c.C572T:p.P191L) variant in FKBP8 (PMID: 29261186). Note the phenotype and MOI are distinct from other reports (PMID: 32969478). FKBP8 remains a candidate gene and so maintaining Amber rating in anticipation of additional cases to corroborate pathogenicity. |
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| Fetal anomalies v1.652 | CLTC | Arina Puzriakova reviewed gene: CLTC: Rating: ; Mode of pathogenicity: None; Publications: 33743358; Phenotypes: Mental retardation, autosomal dominant 56, OMIM:617854; Mode of inheritance: None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.646 | OCRL | Eleanor Williams reviewed gene: OCRL: Rating: ; Mode of pathogenicity: None; Publications: 33517444; Phenotypes: ; Mode of inheritance: None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.643 | FBN2 | Sarah Leigh reviewed gene: FBN2: Rating: ; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: BOTH monoallelic and biallelic, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.641 | FKBP8 | Rhiannon Mellis reviewed gene: FKBP8: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: None; Publications: PMID: 29261186; Phenotypes: Vertebral segmentation defects; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.637 | LARS2 | Arina Puzriakova reviewed gene: LARS2: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: 26537577, 32442335; Phenotypes: Hydrops, lactic acidosis, and sideroblastic anemia, OMIM:617021; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.637 | CLTC | Suzanne Drury reviewed gene: CLTC: Rating: ; Mode of pathogenicity: None; Publications: PMID:33743358; Phenotypes: ; Mode of inheritance: None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.635 | KIDINS220 | Zornitza Stark reviewed gene: KIDINS220: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: 32909676; Phenotypes: limb contractures, ventriculomegaly, stillbirth; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.630 | KIDINS220 | Eleanor Williams reviewed gene: KIDINS220: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: None; Publications: 33205811, 28934391, 28934391; Phenotypes: cerebral ventriculomegaly, limb contractures; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.628 | CDAN1 | Arina Puzriakova reviewed gene: CDAN1: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: 30786798, 29668551, 29599085; Phenotypes: Dyserythropoietic anemia, congenital, type Ia, OMIM:224120, Anemia, congenital dyserythropoietic, type 1a, MONDO:0009135; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.628 | CLP1 | Sarah Leigh reviewed gene: CLP1: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.621 | SYNE1 | Arina Puzriakova reviewed gene: SYNE1: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: 19542096, 24319099, 27782104; Phenotypes: Arthrogryposis multiplex congenita 3, myogenic type, OMIM:618484, Arthrogryposis multiplex congenita 3, myogenic type, MONDO:0032778; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.617 | SLC20A1 |
Arina Puzriakova Added comment: Comment on list classification: New gene added by Zornitza Stark. Rating Amber but there is sufficient evidence to promote to Green. At least three unrelated families with a BEEC phenotype (fetally-relevant) and different heterozygous variants in this gene (PMID: 32850778). In vitro assays and zebrafish model support pathogenicity. |
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| Fetal anomalies v1.393 | GALNT2 | Sarah Leigh reviewed gene: GALNT2: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.350 | CIT | Arina Puzriakova Phenotypes for gene: CIT were changed from PRIMARY MICROCEPHALY to Microcephaly 17, primary, autosomal recessive, OMIM:617090; Microcephaly 17, primary, autosomal recessive, MONDO:0014908 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.347 | CIT | Arina Puzriakova Classified gene: CIT as Amber List (moderate evidence) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.347 | CIT | Arina Puzriakova Added comment: Comment on list classification: Following curation and clinical review at GOSH it has been agreed that the associated phenotype is fetally-relevant. Therefore this gene should be promoted to Green at the next GMS panel update (added 'for-review' tag) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.347 | CIT | Arina Puzriakova Gene: cit has been classified as Amber List (Moderate Evidence). | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.346 | CIT | Arina Puzriakova Tag for-review tag was added to gene: CIT. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.229 | ALG2 | Rhiannon Mellis reviewed gene: ALG2: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Myasthenic syndrome, congenital, 14, with tubular aggregates, 616228, ?Congenital disorder of glycosylation, type Ii, 607906; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.229 | ALG9 | Rhiannon Mellis reviewed gene: ALG9: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Congenital disorder of glycosylation, type Il, 608776; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.229 | ANTXR2 | Rhiannon Mellis reviewed gene: ANTXR2: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: PMID: 30176098, 14508707, 20301698; Phenotypes: Hyaline fibromatosis syndrome, 228600; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.229 | ARFGEF2 | Rhiannon Mellis reviewed gene: ARFGEF2: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Periventricular heterotopia with microcephaly, 608097; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.229 | ATR | Rhiannon Mellis reviewed gene: ATR: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Seckel syndrome 1, 210600; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.229 | B3GALNT2 | Rhiannon Mellis reviewed gene: B3GALNT2: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: PMID:Â 23453667; Phenotypes: Muscular dystrophy-dystroglycanopathy (congenital with brain and eye anomalies, type A, 11, 615181; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.229 | C21orf59 | Rhiannon Mellis reviewed gene: C21orf59: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Ciliary dyskinesia, primary, 26, 615500; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.229 | C2CD3 | Rhiannon Mellis reviewed gene: C2CD3: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Orofaciodigital syndrome XIV, 615948; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.229 | CACNA1G |
Rhiannon Mellis gene: CACNA1G was added gene: CACNA1G was added to Fetal anomalies. Sources: Expert list Mode of inheritance for gene: CACNA1G was set to MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, imprinted status unknown Phenotypes for gene: CACNA1G were set to Spinocerebellar ataxia 42, early-onset, severe, with neurodevelopmental deficits, 618087 Review for gene: CACNA1G was set to GREEN Added comment: This gene and phenotype were reviewed during meetings at Great Ormond Street hospital in October 2020. This gene has a Green evidence rating on at least one other related PanelApp panel. Clinical review and curation was performed by Lyn Chitty, Rhiannon Mellis, and Richard Scott. Outcome of review: Confirmed that phenotype is fetally-relevant: add to the Fetal anomalies panel as a Green gene. Green on related panel(s): Cerebellar hypoplasia Sources: Expert list |
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| Fetal anomalies v1.229 | CCDC151 | Rhiannon Mellis reviewed gene: CCDC151: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Ciliary dyskinesia, primary, 30, 616037; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.229 | CCDC8 | Rhiannon Mellis reviewed gene: CCDC8: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: 3-M syndrome 3, 614205; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.229 | CCDC88C | Rhiannon Mellis reviewed gene: CCDC88C: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Hydrocephalus, congenital, 1, 236600; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.229 | CDK5RAP2 | Rhiannon Mellis reviewed gene: CDK5RAP2: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Microcephaly 3, primary, autosomal recessive, 604804; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.229 | CEP135 | Rhiannon Mellis reviewed gene: CEP135: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Microcephaly 8, primary, autosomal recessive, 614673; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.229 | CEP55 | Rhiannon Mellis reviewed gene: CEP55: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Multinucleated neurons, anhydramnios, renal dysplasia, cerebellar hypoplasia, and hydranencephaly, 236500; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.229 | CEP63 | Rhiannon Mellis reviewed gene: CEP63: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: ?Seckel syndrome 6, 614728; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.229 | CFL2 | Rhiannon Mellis reviewed gene: CFL2: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Nemaline myopathy 7, autosomal recessive, 610687; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.229 | CHMP1A | Rhiannon Mellis reviewed gene: CHMP1A: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Pontocerebellar hypoplasia, type 8, 614961; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.229 | CIT | Rhiannon Mellis reviewed gene: CIT: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Microcephaly 17, primary, autosomal recessive, 617090; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.229 | CLP1 | Rhiannon Mellis reviewed gene: CLP1: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Pontocerebellar hypoplasia, type 10, 615803; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.229 | COG5 | Rhiannon Mellis reviewed gene: COG5: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Congenital disorder of glycosylation, type IIi, 613612; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.228 | COL13A1 | Rhiannon Mellis reviewed gene: COL13A1: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Myasthenic syndrome, congenital, 19, 616720; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.228 | COLEC10 | Rhiannon Mellis reviewed gene: COLEC10: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: 3MC syndrome 3, 248340; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.228 | DDX59 | Rhiannon Mellis reviewed gene: DDX59: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Orofaciodigital syndrome V, 174300; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.227 | DENND5A | Rhiannon Mellis reviewed gene: DENND5A: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Developmental and epileptic encephalopathy 49, 617281; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.225 | DNAAF5 | Rhiannon Mellis reviewed gene: DNAAF5: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Ciliary dyskinesia, primary, 18,614874; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.215 | DPM3 | Rhiannon Mellis reviewed gene: DPM3: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: ?Muscular dystrophy-dystroglycanopathy (congenital with impaired intellectual development), type B, 15, 618992, Muscular dystrophy-dystroglycanopathy (limb-girdle), type C, 15, 612937; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.215 | EED | Rhiannon Mellis reviewed gene: EED: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Cohen-Gibson syndrome, 617561; Mode of inheritance: MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, imprinted status unknown | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.215 | EIF2S3 | Rhiannon Mellis reviewed gene: EIF2S3: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: MEHMO syndrome, 300148; Mode of inheritance: X-LINKED: hemizygous mutation in males, biallelic mutations in females | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.215 | FANCL | Rhiannon Mellis reviewed gene: FANCL: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Fanconi anemia, complementation group L; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.215 | FIG4 | Rhiannon Mellis reviewed gene: FIG4: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Yunis-Varon syndrome, Charcot-Marie-Tooth disease, type 4J, ?Polymicrogyria, bilateral temporooccipital; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.214 | GMNN | Rhiannon Mellis reviewed gene: GMNN: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Meier-Gorlin syndrome 6 OMIM 616835; Mode of inheritance: MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, imprinted status unknown | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.214 | GPC6 | Rhiannon Mellis reviewed gene: GPC6: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Omodysplasia 1; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.214 | GZF1 | Rhiannon Mellis reviewed gene: GZF1: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Joint laxity, short stature, and myopia; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.214 | HESX1 | Rhiannon Mellis reviewed gene: HESX1: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Septooptic dysplasia; Mode of inheritance: BOTH monoallelic and biallelic, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.214 | HIST1H1E | Rhiannon Mellis reviewed gene: HIST1H1E: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Rahman syndrome; Mode of inheritance: MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, imprinted status unknown | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.214 | ITGA8 | Rhiannon Mellis reviewed gene: ITGA8: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Renal hypodysplasia/aplasia 1; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.214 | KIF2A | Rhiannon Mellis reviewed gene: KIF2A: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Cortical dysplasia, complex, with other brain malformations 3; Mode of inheritance: MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, imprinted status unknown | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.214 | KIF5C | Rhiannon Mellis reviewed gene: KIF5C: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Cortical dysplasia, complex, with other brain malformations 2; Mode of inheritance: MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, imprinted status unknown | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.214 | KLHL7 | Rhiannon Mellis reviewed gene: KLHL7: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: PERCHING syndrome; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.214 | LAMB1 | Rhiannon Mellis reviewed gene: LAMB1: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Lissencephaly 5; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.214 | LONP1 | Rhiannon Mellis reviewed gene: LONP1: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: CODAS syndrome; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.214 | MAP3K7 | Rhiannon Mellis reviewed gene: MAP3K7: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Frontometaphyseal dysplasia 2, Cardiospondylocarpofacial syndrome; Mode of inheritance: MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, imprinted status unknown | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.214 | MEOX1 | Rhiannon Mellis reviewed gene: MEOX1: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Klippel-Feil syndrome 2; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.214 | MOGS | Rhiannon Mellis reviewed gene: MOGS: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Congenital disorder of glycosylation, type IIb; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.214 | NEDD4L | Rhiannon Mellis reviewed gene: NEDD4L: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Periventricular nodular heterotopia 7; Mode of inheritance: MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, imprinted status unknown | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.214 | NEK8 | Rhiannon Mellis reviewed gene: NEK8: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: 18199800, 23418306, 26967905, 26697755, 26862157; Phenotypes: NEPHRONOPHTHISIS 9, RENAL-HEPATIC-PANCREATIC DYSPLASIA 2; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.211 | OSGEP | Rhiannon Mellis reviewed gene: OSGEP: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Galloway-Mowat syndrome 3; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.211 | P4HB | Rhiannon Mellis reviewed gene: P4HB: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Cole-Carpenter syndrome 1; Mode of inheritance: MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, imprinted status unknown | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.209 | PGM3 | Rhiannon Mellis reviewed gene: PGM3: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: PMID: 28543917, PMID: 24931394; Phenotypes: Immunodeficiency 23; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.209 | PIGN | Rhiannon Mellis reviewed gene: PIGN: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Multiple congenital anomalies-hypotonia-seizures syndrome 1; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.208 | TMX2 | Arina Puzriakova Phenotypes for gene: TMX2 were changed from Neurodevelopmental disorder with microcephaly, cortical malformations, and spasticity to Neurodevelopmental disorder with microcephaly, cortical malformations, and spasticity, OMIM:618730; Neurodevelopmental disorder with microcephaly, cortical malformations, and spasticity, MONDO:0032887 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.205 | PITX1 | Rhiannon Mellis reviewed gene: PITX1: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Clubfoot, congenital, with or without deficiency of long bones and/or mirror-image polydactyly, Liebenberg syndrome; Mode of inheritance: MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, imprinted status unknown | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.205 | PNPLA1 | Rhiannon Mellis reviewed gene: PNPLA1: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Ichthyosis, congenital, autosomal recessive 10; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.205 | POLR1A | Rhiannon Mellis reviewed gene: POLR1A: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Acrofacial dysostosis, Cincinnati type; Mode of inheritance: MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, imprinted status unknown | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.203 | PRUNE1 | Rhiannon Mellis reviewed gene: PRUNE1: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Neurodevelopmental disorder with microcephaly, hypotonia, and variable brain anomalies; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.203 | PSAT1 | Rhiannon Mellis reviewed gene: PSAT1: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Neu-Laxova syndrome 2; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.202 | PTPN14 | Rhiannon Mellis reviewed gene: PTPN14: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Choanal atresia and lymphedema; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.201 | RBM10 | Rhiannon Mellis reviewed gene: RBM10: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: TARP syndrome; Mode of inheritance: X-LINKED: hemizygous mutation in males, biallelic mutations in females | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.201 | RFT1 | Rhiannon Mellis reviewed gene: RFT1: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Congenital disorder of glycosylation, type In; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.201 | ROBO3 | Rhiannon Mellis reviewed gene: ROBO3: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Gaze palsy, familial horizontal, with progressive scoliosis, 1; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.198 | RPL35A | Rhiannon Mellis reviewed gene: RPL35A: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Diamond-Blackfan anemia 5; Mode of inheritance: MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, imprinted status unknown | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.197 | RPS24 | Rhiannon Mellis reviewed gene: RPS24: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Diamond-blackfan anemia 3; Mode of inheritance: MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, imprinted status unknown | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.195 | RSPH4A | Rhiannon Mellis reviewed gene: RSPH4A: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Ciliary dyskinesia, primary, 11; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.195 | RSPH9 | Rhiannon Mellis reviewed gene: RSPH9: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Ciliary dyskinesia, primary, 12; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.193 | SEC24D | Rhiannon Mellis reviewed gene: SEC24D: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: PMID: 25683121; Phenotypes: Cole-Carpenter syndrome 2; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.192 | SHANK3 | Rhiannon Mellis reviewed gene: SHANK3: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: PHELAN-MCDERMID SYNDROME; Mode of inheritance: MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, imprinted status unknown | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.190 | SLC25A19 | Rhiannon Mellis reviewed gene: SLC25A19: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Microcephaly, Amish type, 607196; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.189 | SLC5A7 | Rhiannon Mellis reviewed gene: SLC5A7: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: PMID: 27569547, 31299140; Phenotypes: Myasthenic syndrome, congenital, 20, presynaptic; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.187 | SMS | Rhiannon Mellis reviewed gene: SMS: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: SNYDER-ROBINSON SYNDROME; Mode of inheritance: X-LINKED: hemizygous mutation in males, biallelic mutations in females | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.187 | SPARC | Rhiannon Mellis reviewed gene: SPARC: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Osteogenesis imperfecta, type XVII; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.187 | SPECC1L | Rhiannon Mellis reviewed gene: SPECC1L: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: ?Facial clefting, oblique, 1, Hypertelorism, Teebi type, Opitz GBBB syndrome, type II; Mode of inheritance: MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, imprinted status unknown | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.187 | ST14 | Rhiannon Mellis reviewed gene: ST14: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Ichthyosis, congenital, autosomal recessive 11; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.187 | STIL | Rhiannon Mellis reviewed gene: STIL: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: 29230157; Phenotypes: Microcephaly 7, primary, autosomal recessive; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.187 | SUFU | Rhiannon Mellis reviewed gene: SUFU: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: 33024317, 21289193; Phenotypes: Joubert syndrome 32; Mode of inheritance: BOTH monoallelic and biallelic (but BIALLELIC mutations cause a more SEVERE disease form), autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.185 | TELO2 | Rhiannon Mellis reviewed gene: TELO2: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: You-Hoover-Fong syndrome; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.185 | TMX2 |
Rhiannon Mellis gene: TMX2 was added gene: TMX2 was added to Fetal anomalies. Sources: Literature Mode of inheritance for gene: TMX2 was set to BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal Phenotypes for gene: TMX2 were set to Neurodevelopmental disorder with microcephaly, cortical malformations, and spasticity Review for gene: TMX2 was set to GREEN Added comment: This gene and phenotype were reviewed during meetings at Great Ormond Street hospital in October 2020. This gene has a Green evidence rating on at least one other related PanelApp panel (Cerebral malformations; Malformations of cortical development; Severe microcephaly). Clinical review and curation was performed by Lyn Chitty, Rhiannon Mellis, and Richard Scott. Outcome of review: Confirmed that phenotype is fetally-relevant: add to the Fetal anomalies panel as a Green gene. Sources: Literature |
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| Fetal anomalies v1.185 | TNNT3 |
Rhiannon Mellis gene: TNNT3 was added gene: TNNT3 was added to Fetal anomalies. Sources: Literature Mode of inheritance for gene: TNNT3 was set to MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, imprinted status unknown Publications for gene: TNNT3 were set to 32779773 Phenotypes for gene: TNNT3 were set to Arthrogryposis, distal, type 2B2 Mode of pathogenicity for gene: TNNT3 was set to Loss-of-function variants (as defined in pop up message) DO NOT cause this phenotype - please provide details in the comments Review for gene: TNNT3 was set to GREEN Added comment: This gene and phenotype were reviewed during meetings at Great Ormond Street hospital in October 2020. This gene has a Green evidence rating on at least one other related PanelApp panel. Clinical review and curation was performed by Lyn Chitty, Rhiannon Mellis, and Richard Scott. Outcome of review: Confirmed that phenotype is fetally-relevant: add to the Fetal anomalies panel as a Green gene. Additional comment: Clearly documented phenotype of distal arthrogryposis. Also, recent paper in Prenatal Diagnosis reporting a het pathogenic variant in TNNT3 in a fetus with FADS; that variant has previously only been described in a family with much milder distal arthrogryposis phenotype. PMID: 32779773 (copied from OMIM): In in vitro studies, Robinson et al. (2007) demonstrated that the TNNI2 R174Q (191043.0001) and R156X (191043.0002) mutations and the TNNT3 mutation R63H (600692.0001) resulted in a gain of function with increased ATPase activity in actin-activated myosin ATPase assays, reflecting increased calcium sensitivity and consistent with increased contractility. In patients, Robinson et al. (2007) concluded that the mutation would cause increased tension in developing muscles, thus resulting in contractures and limb deformities via an active process rather than a passive process. These findings implicated disturbed muscle function as the pathogenic mechanism underlying DA2B. Sources: Literature |
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| Fetal anomalies v1.185 | TOE1 | Rhiannon Mellis reviewed gene: TOE1: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Pontocerebellar hypoplasia, type 7; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.185 | TRAIP | Rhiannon Mellis reviewed gene: TRAIP: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Seckel syndrome 9; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.185 | TSEN2 | Rhiannon Mellis reviewed gene: TSEN2: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Pontocerebellar hypoplasia type 2B; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.185 | TSEN34 | Rhiannon Mellis reviewed gene: TSEN34: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Pontocerebellar hypoplasia type 2C; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.185 | TUBB3 | Rhiannon Mellis reviewed gene: TUBB3: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Cortical dysplasia, complex, with other brain malformations 1; Mode of inheritance: MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, imprinted status unknown | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.185 | TUBG1 | Rhiannon Mellis reviewed gene: TUBG1: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Cortical dysplasia, complex, with other brain malformations 4; Mode of inheritance: MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, imprinted status unknown | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.185 | TUBGCP4 | Rhiannon Mellis reviewed gene: TUBGCP4: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Microcephaly and chorioretinopathy, autosomal recessive, 3; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.185 | UBE2T | Rhiannon Mellis reviewed gene: UBE2T: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Fanconi anemia, complementation group T; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.185 | USP9X | Rhiannon Mellis reviewed gene: USP9X: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: MENTAL RETARDATION, X-LINKED 99, MRX99; Mode of inheritance: X-LINKED: hemizygous mutation in males, monoallelic mutations in females may cause disease (may be less severe, later onset than males) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.185 | VRK1 | Rhiannon Mellis reviewed gene: VRK1: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Pontocerebellar hypoplasia type 1A; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.185 | WDR73 | Rhiannon Mellis reviewed gene: WDR73: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Galloway-Mowat syndrome 1; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.185 | XYLT2 | Rhiannon Mellis reviewed gene: XYLT2: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Spondyloocular syndrome; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.185 | ZMYND10 | Rhiannon Mellis reviewed gene: ZMYND10: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Ciliary dyskinesia, primary, 22; Mode of inheritance: MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, imprinted status unknown | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.185 | ZSWIM6 | Rhiannon Mellis reviewed gene: ZSWIM6: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Acromelic frontonasal dysostosis; Mode of inheritance: MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, imprinted status unknown | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.185 | ABL1 | Rhiannon Mellis reviewed gene: ABL1: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: Congenital heart defects and skeletal malformations syndrome; Mode of inheritance: MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, imprinted status unknown | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.184 | NUAK2 |
Arina Puzriakova Added comment: Comment on list classification: New gene added by Zornitza Stark. Single consanguineous family with three consecutive fetuses with anencephaly. Exome sequencing revealed a recessive 21-bp in-frame deletion in NUAK2 segregating with the disease. Pathogenicity is supported by in vitro and animal model data. Rating Amber, awaiting further cases/clinical evidence prior to inclusion as diagnostic-grade (added 'watchlist' tag) |
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| Fetal anomalies v1.182 | AMBRA1 | Arina Puzriakova reviewed gene: AMBRA1: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: None; Publications: 32333458, 17589504; Phenotypes: Neural tube defects; Mode of inheritance: MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, NOT imprinted | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.169 | NONO | Arina Puzriakova reviewed gene: NONO: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: None; Publications: 32397791; Phenotypes: ; Mode of inheritance: X-LINKED: hemizygous mutation in males, biallelic mutations in females | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.160 | TRAPPC12 | Arina Puzriakova Phenotypes for gene: TRAPPC12 were changed from Progressive Childhood Encephalopathy and Golgi Dysfunction to Hydrocephaly; Encephalopathy, progressive, early-onset, with brain atrophy and spasticity, OMIM:617669; Early-onset progressive encephalopathy-hearing loss-pons hypoplasia-brain atrophy syndrome, MONDO:0044696 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.158 | TRAPPC12 | Arina Puzriakova reviewed gene: TRAPPC12: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: None; Publications: 32347653, 28777934; Phenotypes: Hydrocephaly, Encephalopathy, progressive, early-onset, with brain atrophy and spasticity, OMIM:617669, Early-onset progressive encephalopathy-hearing loss-pons hypoplasia-brain atrophy syndrome, MONDO:0044696; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.134 | AKT1 | Eleanor Williams reviewed gene: AKT1: Rating: ; Mode of pathogenicity: None; Publications: 33030203; Phenotypes: ; Mode of inheritance: None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.121 | GDF6 | Zornitza Stark reviewed gene: GDF6: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: 32737436; Phenotypes: Syndromic CAKUT; Mode of inheritance: MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, NOT imprinted | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.121 | MYL9 | Zornitza Stark reviewed gene: MYL9: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: None; Publications: 29453416, 33031641; Phenotypes: Megacystis-microcolon-intestinal hypoperistalsis syndrome; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.120 | ALDH7A1 | Eleanor Williams reviewed gene: ALDH7A1: Rating: ; Mode of pathogenicity: None; Publications: 32969477; Phenotypes: ; Mode of inheritance: None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.115 | SCN1A | Arina Puzriakova reviewed gene: SCN1A: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: 32928894, 29543227; Phenotypes: Dravet syndrome, OMIM:607208, Arthrogryposis multiplex congenita; Mode of inheritance: MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, imprinted status unknown | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.115 | MN1 |
Rhiannon Mellis gene: MN1 was added gene: MN1 was added to Fetal anomalies. Sources: Literature Mode of inheritance for gene: MN1 was set to MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, imprinted status unknown Publications for gene: MN1 were set to 31834374; 31839203; 15870292 Phenotypes for gene: MN1 were set to CEBALID syndrome, 618774 Mode of pathogenicity for gene: MN1 was set to Other Review for gene: MN1 was set to GREEN Added comment: Copied from MN1 review on Cortical malformations panel: Associated with phenotype in OMIM, and a probable gene for MN1 C-terminal truncation syndrome in G2P. Over 20 unrelated probands reported with heterozygous MN1 truncating variants, associated with a distinct phenotype which includes DD, craniofacial abnormalities, hearing loss, and structural abnormalities in the brain (e.g. polymicrogyria, dysmorphic corpus callosum and anomalies of the cerebellum - rhombencephalosynapsis). Most variants cluster in the C-terminal, and all were predicted to escape NMD. Authors postulated that the resulting truncated protein may have a dominant-negative or gain-of-function effect. Also phenotypically supportive knockout mouse model. Sources: Literature |
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| Fetal anomalies v1.108 | TRAPPC12 | Rhiannon Mellis reviewed gene: TRAPPC12: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: 32347653; Phenotypes: Hydrocephaly; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.108 | MFSD2A | Arina Puzriakova Phenotypes for gene: MFSD2A were changed from MICROCEPHALY 15, PRIMARY, AUTOSOMAL RECESSIVE to Neurodevelopmental disorder with progressive microcephaly, spasticity, and brain imaging abnormalities, 616486 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.103 | USP18 | Arina Puzriakova reviewed gene: USP18: Rating: ; Mode of pathogenicity: None; Publications: 31940699; Phenotypes: Pseudo-TORCH syndrome 2, 617397; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.101 | TMEM260 | Rhiannon Mellis reviewed gene: TMEM260: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: None; Publications: PMID: 28318500; Phenotypes: STructural heart defects, Renal anomalies, Agenesis of corpus callosum; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.100 | CTNND1 | Eleanor Williams reviewed gene: CTNND1: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: 32196547; Phenotypes: Blepharocheilodontic syndrome 2, 617681, cardiovascular anomalies, developmental delay, choanal atresia; Mode of inheritance: MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, imprinted status unknown | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.99 | TRPM7 | Eleanor Williams reviewed gene: TRPM7: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: None; Publications: 32503408, 31423533; Phenotypes: Cardiac arrhythmia, stillbirth; Mode of inheritance: MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, imprinted status unknown | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.98 | FOXC1 | Eleanor Williams reviewed gene: FOXC1: Rating: ; Mode of pathogenicity: None; Publications: 32720677; Phenotypes: ; Mode of inheritance: None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.98 | NEK9 | Rhiannon Mellis reviewed gene: NEK9: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: None; Publications: PMID: 26908619, 26633546; Phenotypes: ; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.97 | SMN1 | Eleanor Williams reviewed gene: SMN1: Rating: ; Mode of pathogenicity: None; Publications: 32644125, 32644120; Phenotypes: Spinal muscular atrophy; Mode of inheritance: None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.97 | GREB1L | Rhiannon Mellis reviewed gene: GREB1L: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: None; Publications: PMID: 31424080, 32378186; Phenotypes: Renal agenesis; Mode of inheritance: MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, NOT imprinted | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.97 | AGRN | Rhiannon Mellis reviewed gene: AGRN: Rating: RED; Mode of pathogenicity: None; Publications: PMID: 31730230; Phenotypes: Fetal akinesia deformation sequence; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.97 | ATP1A2 | Rhiannon Mellis reviewed gene: ATP1A2: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: PMID: 31608932; Phenotypes: ; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.95 | AHCY | Arina Puzriakova reviewed gene: AHCY: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: 31957987; Phenotypes: Hypermethioninemia with deficiency of S-adenosylhomocysteine hydrolase, 613752; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.95 | ASXL3 | Rhiannon Mellis reviewed gene: ASXL3: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: None; Publications: PMID: 29316359; Phenotypes: ; Mode of inheritance: MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, NOT imprinted | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.95 | B9D1 | Rhiannon Mellis reviewed gene: B9D1: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: None; Publications: 32622957, 24886560; Phenotypes: ; Mode of inheritance: None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.95 | TMEM216 | Rhiannon Mellis reviewed gene: TMEM216: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: PMID: 20036350, 20512146; Phenotypes: Joubert syndrome, Meckel syndrome; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal; Current diagnostic: yes | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.95 | TOGARAM1 | Arina Puzriakova Added comment: Comment on list classification: Single family. Additional cases required to corroborate pathogenicity. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.88 | PSAT1 | Sarah Leigh reviewed gene: PSAT1: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.74 | OTX2 | Eleanor Williams reviewed gene: OTX2: Rating: ; Mode of pathogenicity: None; Publications: 32277752; Phenotypes: ; Mode of inheritance: None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.74 | NONO | Suzanne Drury reviewed gene: NONO: Rating: ; Mode of pathogenicity: None; Publications: 32397791; Phenotypes: ; Mode of inheritance: None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.74 | SNAP29 | Rhiannon Mellis reviewed gene: SNAP29: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: None; Publications: PMID: 15968592, 21073448, 28388629; Phenotypes: CEDNIK syndrome; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.73 | ACVR2B | Zornitza Stark reviewed gene: ACVR2B: Rating: RED; Mode of pathogenicity: None; Publications: 9916847, 30622330, 21864452; Phenotypes: Heterotaxy, visceral, 4, autosomal 613751; Mode of inheritance: MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, NOT imprinted | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.63 | ACTG2 | Rebecca Foulger Mode of pathogenicity for gene: ACTG2 was changed from to Other | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.11 | MYL9 | Rhiannon Mellis reviewed gene: MYL9: Rating: RED; Mode of pathogenicity: ; Publications: 29453416; Phenotypes: Megacystis Microcolon Intestinal Hypoperistalsis Syndrome (MMIH); Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.11 | LMOD1 | Rhiannon Mellis reviewed gene: LMOD1: Rating: RED; Mode of pathogenicity: ; Publications: 28292896; Phenotypes: Megacystis Microcolon Intestinal Hypoperistalsis Syndrome (MMIH); Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.11 | MYH11 | Rhiannon Mellis reviewed gene: MYH11: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: 25407000, 29575632, 31427716; Phenotypes: Megacystis Microcolon Intestinal Hypoperistalsis Syndrome (MMIH); Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.11 | MYLK | Rhiannon Mellis reviewed gene: MYLK: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: 28602422; Phenotypes: Megacystis Microcolon Intestinal Hypoperistalsis Syndrome (MMIH); Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.3 | TUBA8 | Zornitza Stark reviewed gene: TUBA8: Rating: RED; Mode of pathogenicity: None; Publications: 19896110, 31481326, 28388629; Phenotypes: Cortical dysplasia, complex, with other brain malformations 8, MIM# 613180; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.3 | SMG9 | Zornitza Stark reviewed gene: SMG9: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: 27018474, 31390136; Phenotypes: Heart and brain malformation syndrome, MIM# 616920; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.0 | ALG9 | Zornitza Stark reviewed gene: ALG9: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: 26453364, 31420886; Phenotypes: Congenital disorder of glycosylation, type Il, MIM#608776; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal; Current diagnostic: yes | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v1.0 | PSAT1 | Zornitza Stark reviewed gene: PSAT1: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: 25152457; Phenotypes: Neu-Laxova syndrome 2, MIM# 616038; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal; Current diagnostic: yes | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.367 | BICD2 | Rebecca Foulger Mode of pathogenicity for gene: BICD2 was changed from to Other | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.360 | KLF1 | Rebecca Foulger Mode of pathogenicity for gene: KLF1 was changed from to Other | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.346 | BICD2 | Suzanne Drury reviewed gene: BICD2: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: 27751653, 29274205, 28635954; Phenotypes: HP:0002804, HP:0001059; Mode of inheritance: MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, imprinted status unknown | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.342 | ANAPC1 | Rebecca Foulger reviewed gene: ANAPC1: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.339 | GJB2 | Anna de Burca reviewed gene: GJB2: Rating: ; Mode of pathogenicity: None; Publications: 24346921; Phenotypes: ; Mode of inheritance: None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.324 | TRPV6 |
Rebecca Foulger gene: TRPV6 was added gene: TRPV6 was added to Fetal anomalies. Sources: Literature Mode of inheritance for gene: TRPV6 was set to BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal Publications for gene: TRPV6 were set to 29861107 Phenotypes for gene: TRPV6 were set to Transient Neonatal Hyperparathyroidism; Hyperparathyroidism, transient neonatal, 618188 Review for gene: TRPV6 was set to AMBER Added comment: New gene:disorder association added to DDG2P in March 2019: Transient Neonatal Hyperparathyroidism. DDG2P Disease confidence: probable. DDG2P mode of pathogenicity/mutation consequence: loss of function. DDG2P mode of inheritance: biallelic. Sources: Literature |
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| Fetal anomalies v0.311 | MYH10 | Rebecca Foulger reviewed gene: MYH10: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.311 | NDUFAF5 | Rebecca Foulger reviewed gene: NDUFAF5: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: 18940309, 21620786, 30266093; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.311 | INTU | Rebecca Foulger reviewed gene: INTU: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: 28289185, 29451301; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.311 | FRMD4A | Rebecca Foulger reviewed gene: FRMD4A: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: 25388005, 30214071; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.311 | EIF2B2 | Rebecca Foulger reviewed gene: EIF2B2: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: 28597716; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.311 | DOK7 | Rebecca Foulger reviewed gene: DOK7: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.311 | BCL9L | Rebecca Foulger reviewed gene: BCL9L: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: 23035047; Phenotypes: Heterotaxy; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.305 | NDP | Rhiannon Mellis reviewed gene: NDP: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: 30125416; Phenotypes: Norrie disease; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.305 | BRCA2 | Lyn Chitty reviewed gene: BRCA2: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: Fanconi anemia; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.298 | GBE1 | Anna de Burca reviewed gene: GBE1: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: 21620786; Phenotypes: Fetal akinesia deformation sequence; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.298 | COQ4 | Anna de Burca reviewed gene: COQ4: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: 25658047; Phenotypes: COENZYME Q10 DEFICIENCY, PRIMARY; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.298 | DOLK | Rebecca Foulger Mode of pathogenicity for gene: DOLK was changed from to Other | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.295 | PDHA1 | Anna de Burca reviewed gene: PDHA1: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: 26865159; Phenotypes: Pyruvate dehydrogenase E1-alpha deficiency; Mode of inheritance: X-LINKED: hemizygous mutation in males, monoallelic mutations in females may cause disease (may be less severe, later onset than males) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.294 | KIAA1109 |
Rebecca Foulger Added comment: Comment on mode of pathogenicity: The Mode of pathogenicity recorded in Gene2Phenotype for the disorder 'Brain atrophy, Dandy Walker and Contractures' is: All missense/in frame. However, as summarised in PMID:29290337 (Gueneau et al., 2018), case subjects compatible with life carry missense variants but many of the more severely affected cases harbor homozygous or compound het truncating alleles. Therefore changed the Mode of pathogenicity back to default so LOF variants are captured. |
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| Fetal anomalies v0.294 | KIAA1109 | Rebecca Foulger Mode of pathogenicity for gene: KIAA1109 was changed from Other to None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.290 | KIAA1109 | Rebecca Foulger Mode of pathogenicity for gene: KIAA1109 was changed from to Other | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.278 | H19 | Richard Scott reviewed gene: H19: Rating: RED; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.277 | PKD1 | Rebecca Foulger Added comment: Comment on mode of inheritance: Although not yet listed in DD-Gene2Phenotype, PKD1 is listed in OMIM with AD inheritance for Polycystic kidney disease 1, 173900. Monoallelic MOI was also listed in the original PAGE Additional gene list. However the external review and the two cited papers support both AD and AR inheritance for polycystic kidney disease (PKD). PMID:23624871 note that recessive polycystic kidney disease (ARPKD) frequently presents antenatally or in the neonatal period with severe renal involvement. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.273 | PKD1 | Julia Baptista reviewed gene: PKD1: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: PMID: 20558538, 23624871; Phenotypes: ; Mode of inheritance: BOTH monoallelic and biallelic, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.273 | ZFP57 | Anna de Burca reviewed gene: ZFP57: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.247 | CNOT1 | Rebecca Foulger reviewed gene: CNOT1: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.246 | CNOT1 |
Rebecca Foulger gene: CNOT1 was added gene: CNOT1 was added to Fetal anomalies. Sources: DD-Gene2Phenotype,Expert Review Amber Mode of inheritance for gene: CNOT1 was set to MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, imprinted status unknown Publications for gene: CNOT1 were set to 31006510; 31006513 Phenotypes for gene: CNOT1 were set to pancreatic agenesis and holoprosencephaly syndrome Mode of pathogenicity for gene: CNOT1 was set to Other - please provide details in the comments |
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| Fetal anomalies v0.244 | HNRNPK | Rebecca Foulger reviewed gene: HNRNPK: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.242 | MYT1 | Rebecca Foulger Mode of pathogenicity for gene: MYT1 was changed from to Other | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.241 | H19 | Rebecca Foulger Mode of pathogenicity for gene: H19 was changed from to Other | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.236 | TUBB2A | Rebecca Foulger Mode of pathogenicity for gene: TUBB2A was changed from to Other | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.222 | ASCC1 | Rebecca Foulger reviewed gene: ASCC1: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.207 | ROBO1 | Rebecca Foulger commented on gene: ROBO1: Evidence for inclusion on the PAGE Additional gene list comes from a single study in Kruszka et al. (2017, PMID:28592524) but 3 families of different ethnicities; each proband had a ventricular septal defect, and one proband had tetralogy of Fallot. Plus proband 1 had craniofacial findings, consistent with the mouse model. VSD can be detected prenatally (e.g. see PMID:24456562) so is relevant for the panel. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.199 | COG4 |
Rebecca Foulger commented on gene: COG4: COG4 is Green on the fetal panel based on 'confirmed' rating for a biallelic glycosylation disorder (COG4-CDG) and expert clinical review. A probable gene:disease disorder also exists in DD-Gene2Phenotype: Saul-Wilson syndrome. DDG2P Disease confidence: probable. DDG2P mode of pathogenicity/mutation consequence: all missense/in frame, gain of function. DDG2P mode of inheritance: monoallelic. Saul-Wilson syndrome is a rare form of primordial dwarfism with severe pre-and postnatal growth retardation, and characteristic facial and radiographic features (PMID:30290151). Fetal relevance was confirmed by Anna de Burca but the evidence requires further investigation before the MOI is expanded to include monoallelic variants. |
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| Fetal anomalies v0.197 | DSTYK | Rebecca Foulger commented on gene: DSTYK: Note that a new gene:disorder association was added to DDG2P in March 2019: Autosomal Recessive Complicated Spastic Paraparesis SPG23. DDG2P Disease confidence: probable. DDG2P mode of pathogenicity/mutation consequence: loss of function. DDG2P mode of inheritance: biallelic. Not yet included the spastic paraplegia phenotype (or biallelic inheritance) on this Fetal anomalies panel for DSTYK because the 3 families identified in PMID:28157540 have the same variant, and haplotype analysis suggests a Founder effect. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.193 | FBXO11 | Rebecca Foulger reviewed gene: FBXO11: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.193 | CACNA1E | Rebecca Foulger reviewed gene: CACNA1E: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.193 | TOP3A | Rebecca Foulger reviewed gene: TOP3A: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.193 | SUZ12 | Rebecca Foulger reviewed gene: SUZ12: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.193 | SPTBN2 | Rebecca Foulger reviewed gene: SPTBN2: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.193 | SIM1 | Rebecca Foulger reviewed gene: SIM1: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.193 | SEPSECS | Rebecca Foulger reviewed gene: SEPSECS: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.193 | DNAH9 | Rebecca Foulger reviewed gene: DNAH9: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.193 | C11orf70 | Rebecca Foulger reviewed gene: C11orf70: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.192 | CACNA1E |
Rebecca Foulger gene: CACNA1E was added gene: CACNA1E was added to Fetal anomalies. Sources: DD-Gene2Phenotype,Expert Review Green Mode of inheritance for gene: CACNA1E was set to MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, imprinted status unknown Publications for gene: CACNA1E were set to 30849329 Phenotypes for gene: CACNA1E were set to Developmental and Epileptic Encephalopathy with Contractures Macrocephaly and Dyskinesias; Epileptic Encephalopathy with Contractures, Macrocephaly, and Dyskinesia Mode of pathogenicity for gene: CACNA1E was set to Other - please provide details in the comments |
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| Fetal anomalies v0.189 | VPS53 | Rebecca Foulger commented on gene: VPS53: VPS53 was added to the Fetal anomalies panel from the PAGE Additional Gene List (with rating: probable). New gene:disorder association added to DDG2P in March 2019: Progressive cerebella-cerebral atrophy type 2. DDG2P Disease confidence: confirmed. DDG2P mode of pathogenicity/mutation consequence: loss of function. DDG2P mode of inheritance: biallelic. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.188 | PCGF2 | Rebecca Foulger commented on gene: PCGF2: New gene:disorder association added to DDG2P in March 2019: Craniofacial Neurological Cardiovascular and Skeletal Features. DDG2P Disease confidence: confirmed. DDG2P mode of pathogenicity/mutation consequence: all missense/in frame. DDG2P mode of inheritance: monoallelic. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.166 | QDPR | Rebecca Foulger edited their review of gene: QDPR: Added comment: This gene and phenotype were discussed during review of borderline cases in April 2019. Clinical review and curation was performed by Lyn Chitty, Anna de Burca, Rhiannon Mellis, Richard Scott, Ellen McDonagh and Rebecca Foulger. Outcome of review: Phenotype is not fetally-relevant. Additional notes from clinical review: Although not explicitly stated, microcephaly is implied to be progressive. Action taken: Demoted gene rating from Green to Red.; Changed rating: RED | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.156 | SAMD9 | Rebecca Foulger Added comment: Comment on mode of pathogenicity: Changed the Mode of Pathogenicity to 'Other' following review of the gene by Anna de Burca (Genomics England) and Rhiannon Mellis (GOSH) in March 2019. They note that the AD inheritance may be gain-of-function. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.156 | SAMD9 | Rebecca Foulger Mode of pathogenicity for gene: SAMD9 was changed from to Other | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.152 | POLR3A | Rebecca Foulger Added comment: Comment on phenotypes: New gene:disorder association added to DDG2P on 27/03/2019 (after expert clinical review of POLR3A on Fetal anomalies panel): Autosomal Recessive Wiedemann Rautenstrauch Syndrome. DDG2P Disease confidence for Wiedemann Rautenstrauch Syndrome: confirmed. DDG2P mode of pathogenicity/mutation consequence for Wiedemann Rautenstrauch Syndrome: loss of function. DDG2P mode of inheritance for Wiedemann Rautenstrauch Syndrome: biallelic. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.149 | ROR2 | Rebecca Foulger commented on gene: ROR2: In the original PAGE file, Mode of Inheritance is recorded as Biallelic for 'ROR2-RELATED DISORDERS AR', and Monoallelic for 'BRACHYDACTYLY, TYPE B1' and 'ROBINOW SYNDROME, AUTOSOMAL DOMINANT'. All three disorders have 'Confirmed' gene:disease associations with 'Loss of function' mode-of-pathogenicity. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.127 | FARS2 | Rebecca Foulger reviewed gene: FARS2: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.127 | KCNJ8 | Rebecca Foulger reviewed gene: KCNJ8: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.126 | KCNJ8 |
Rebecca Foulger gene: KCNJ8 was added gene: KCNJ8 was added to Fetal anomalies. Sources: DD-Gene2Phenotype,Expert Review Amber Mode of inheritance for gene: KCNJ8 was set to MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, imprinted status unknown Publications for gene: KCNJ8 were set to 24176758; 24700710; 25275207 Phenotypes for gene: KCNJ8 were set to Cantu syndrome Mode of pathogenicity for gene: KCNJ8 was set to Other - please provide details in the comments |
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| Fetal anomalies v0.124 | TALDO1 | Rebecca Foulger reviewed gene: TALDO1: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.124 | SOS2 | Rebecca Foulger reviewed gene: SOS2: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.124 | LZTR1 | Rebecca Foulger reviewed gene: LZTR1: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.124 | LIPA | Rebecca Foulger reviewed gene: LIPA: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.124 | HBA2 | Rebecca Foulger reviewed gene: HBA2: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.124 | HBA1 | Rebecca Foulger reviewed gene: HBA1: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.124 | SGPL1 | Rebecca Foulger reviewed gene: SGPL1: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.120 | UFC1 | Rebecca Foulger Added comment: Comment on mode of inheritance: No MOI is given in DDG2P for Severe early-onset encephalopathy with progressive microcephaly. Set MOI to 'biallelic' to match OMIM 'Neurodevelopmental disorder with spasticity and poor growth, 618076'. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.116 | SAMD9 | Rebecca Foulger reviewed gene: SAMD9: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.116 | SLC10A7 | Rebecca Foulger reviewed gene: SLC10A7: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.116 | KMT2E | Rebecca Foulger reviewed gene: KMT2E: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.116 | TRAF7 | Rebecca Foulger reviewed gene: TRAF7: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.116 | SLC52A2 | Rebecca Foulger reviewed gene: SLC52A2: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.116 | STAG2 | Rebecca Foulger reviewed gene: STAG2: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.116 | UFC1 | Rebecca Foulger reviewed gene: UFC1: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.116 | UFM1 | Rebecca Foulger reviewed gene: UFM1: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.115 | TRAF7 |
Rebecca Foulger gene: TRAF7 was added gene: TRAF7 was added to Fetal anomalies. Sources: DD-Gene2Phenotype,Expert Review Green Mode of inheritance for gene: TRAF7 was set to MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, imprinted status unknown Publications for gene: TRAF7 were set to 29961569 Phenotypes for gene: TRAF7 were set to Developmental Delay, Congenital Anomalies, and Dysmorphic Features Mode of pathogenicity for gene: TRAF7 was set to Other - please provide details in the comments |
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| Fetal anomalies v0.102 | TWIST2 | Rebecca Foulger Added comment: Comment on mode of pathogenicity: Changed MOP to 'Other' based on comment by Deirdre Cilliers: gain of function for Barber-Say and ablepharon-macrostomia syndrome, which are relevant to this fetal panel. As noted in original upload, DD-G2P record a 'loss of function' mechanism for SETLEIS SYNDROME, but this wouldn't present prenatally (see comment from Deirdre Cilliers). | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.102 | TWIST2 | Rebecca Foulger Mode of pathogenicity for gene: TWIST2 was changed from to Other | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.86 | EMG1 | Rebecca Foulger Mode of pathogenicity for gene: EMG1 was changed from to Other | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.85 | EMG1 | Rebecca Foulger Mode of pathogenicity for gene: EMG1 was changed from to Other | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.78 | IFIH1 | Rebecca Foulger Mode of pathogenicity for gene: IFIH1 was changed from to Other | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.55 | ATAD3A | Rebecca Foulger Mode of pathogenicity for gene: ATAD3A was changed from to Loss-of-function variants (as defined in pop up message) DO NOT cause this phenotype - please provide details in the comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.43 | ACTB | Rebecca Foulger Added comment: Comment on mode of pathogenicity: Anna notes that there is good evidence for GOF variants causing Baraitser-Winter syndrome but there is also a paper from DDD (PMID:29220674) reporting LOF variants associated predominantly with developmental delay but in some cases structural anomalies including congenital heart defects and/or CAKUT- this may not be a severe enough prenatal phenotype for inclusion in a fetal panel but overall Anna notes that it is probably reasonable to report any variants in this gene, whether GOF or LOF. Therefore no exception to LOF was added to the MOP section. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.43 | ACTB | Rebecca Foulger Mode of pathogenicity for gene: ACTB was changed from to None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.41 | BGN | Anna de Burca reviewed gene: BGN: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: None; Publications: PMID: 27236923, 27632686; Phenotypes: Spondyloepimetaphyseal dysplasia, X-linked, Meester-Loeys syndrome; Mode of inheritance: MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, NOT imprinted | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.34 | ATAD3A | Anna de Burca reviewed gene: ATAD3A: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: Loss-of-function variants (as defined in pop up message) DO NOT cause this phenotype - please provide details in the comments; Publications: PMID: 27640307, 28327206; Phenotypes: Harel-Yoon syndrome; Mode of inheritance: MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, NOT imprinted | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.34 | ACTB | Anna de Burca reviewed gene: ACTB: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: PMID: 22366783, 29220674, 26275891; Phenotypes: Baraitser-Winter syndrome 1; Mode of inheritance: MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, NOT imprinted | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.34 | PIEZO1 | Anna de Burca reviewed gene: PIEZO1: Rating: GREEN; Mode of pathogenicity: None; Publications: PMID: 26333996, 23695678; Phenotypes: Lymphatic malformation 6, Dehydrated hereditary stomatocytosis with or without pseudohyperkalemia and/or perinatal edema; Mode of inheritance: BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.30 | TPM2 | Rebecca Foulger Mode of pathogenicity for gene: TPM2 was changed from to Other | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.27 | RBPJ | Rebecca Foulger Mode of pathogenicity for gene: RBPJ was changed from to Other | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.11 | AKT3 | Rebecca Foulger Mode of pathogenicity for gene: AKT3 was changed from to Other | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | ZNF750 | Rebecca Foulger reviewed gene: ZNF750: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | ZNF711 | Rebecca Foulger reviewed gene: ZNF711: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | ZNF462 | Rebecca Foulger reviewed gene: ZNF462: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | ZNF423 | Rebecca Foulger reviewed gene: ZNF423: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | ZMYND11 | Rebecca Foulger reviewed gene: ZMYND11: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | ZMYND10 | Rebecca Foulger reviewed gene: ZMYND10: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | ZMPSTE24 | Rebecca Foulger reviewed gene: ZMPSTE24: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | ZIC2 | Rebecca Foulger reviewed gene: ZIC2: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | ZFYVE26 | Rebecca Foulger reviewed gene: ZFYVE26: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | ZFP57 | Rebecca Foulger reviewed gene: ZFP57: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | ZEB2 | Rebecca Foulger reviewed gene: ZEB2: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | ZDHHC9 | Rebecca Foulger reviewed gene: ZDHHC9: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | ZBTB18 | Rebecca Foulger reviewed gene: ZBTB18: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | YAP1 | Rebecca Foulger reviewed gene: YAP1: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | XYLT2 | Rebecca Foulger reviewed gene: XYLT2: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | XYLT1 | Rebecca Foulger reviewed gene: XYLT1: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | XRCC4 | Rebecca Foulger reviewed gene: XRCC4: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | XPC | Rebecca Foulger reviewed gene: XPC: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | XPA | Rebecca Foulger reviewed gene: XPA: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | WNT3 | Rebecca Foulger reviewed gene: WNT3: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | WNT10B | Rebecca Foulger reviewed gene: WNT10B: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | WNT1 | Rebecca Foulger reviewed gene: WNT1: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | WDR73 | Rebecca Foulger reviewed gene: WDR73: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | WDR62 | Rebecca Foulger reviewed gene: WDR62: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | WDR60 | Rebecca Foulger reviewed gene: WDR60: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | WDR45 | Rebecca Foulger reviewed gene: WDR45: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | WDR35 | Rebecca Foulger reviewed gene: WDR35: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | WDR26 | Rebecca Foulger reviewed gene: WDR26: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | WDPCP | Rebecca Foulger reviewed gene: WDPCP: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | WASHC5 | Rebecca Foulger reviewed gene: WASHC5: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | WAC | Rebecca Foulger reviewed gene: WAC: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | VRK1 | Rebecca Foulger reviewed gene: VRK1: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | VPS53 | Rebecca Foulger reviewed gene: VPS53: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | VPS33B | Rebecca Foulger reviewed gene: VPS33B: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | VPS13B | Rebecca Foulger reviewed gene: VPS13B: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | VLDLR | Rebecca Foulger reviewed gene: VLDLR: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | VIPAS39 | Rebecca Foulger reviewed gene: VIPAS39: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | VDR | Rebecca Foulger reviewed gene: VDR: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | UVSSA | Rebecca Foulger reviewed gene: UVSSA: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | USP27X | Rebecca Foulger reviewed gene: USP27X: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | USP18 | Rebecca Foulger reviewed gene: USP18: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | USB1 | Rebecca Foulger reviewed gene: USB1: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | UROS | Rebecca Foulger reviewed gene: UROS: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | UQCRB | Rebecca Foulger reviewed gene: UQCRB: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | UPF3B | Rebecca Foulger reviewed gene: UPF3B: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | UNC80 | Rebecca Foulger reviewed gene: UNC80: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | UMPS | Rebecca Foulger reviewed gene: UMPS: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | UGT1A1 | Rebecca Foulger reviewed gene: UGT1A1: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | UBR1 | Rebecca Foulger reviewed gene: UBR1: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | UBE3B | Rebecca Foulger reviewed gene: UBE3B: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | UBE2T | Rebecca Foulger reviewed gene: UBE2T: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | UBE2A | Rebecca Foulger reviewed gene: UBE2A: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | UBA5 | Rebecca Foulger reviewed gene: UBA5: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | UBA1 | Rebecca Foulger reviewed gene: UBA1: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | TYRP1 | Rebecca Foulger reviewed gene: TYRP1: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | TYR | Rebecca Foulger reviewed gene: TYR: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | TXNL4A | Rebecca Foulger reviewed gene: TXNL4A: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | TWIST1 | Rebecca Foulger reviewed gene: TWIST1: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | TUSC3 | Rebecca Foulger reviewed gene: TUSC3: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | TUBGCP6 | Rebecca Foulger reviewed gene: TUBGCP6: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | TUBGCP4 | Rebecca Foulger reviewed gene: TUBGCP4: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | TUBA8 | Rebecca Foulger reviewed gene: TUBA8: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | TTC7A | Rebecca Foulger reviewed gene: TTC7A: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | TTC37 | Rebecca Foulger reviewed gene: TTC37: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | TTC25 | Rebecca Foulger reviewed gene: TTC25: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | TTC21B | Rebecca Foulger reviewed gene: TTC21B: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | TTC19 | Rebecca Foulger reviewed gene: TTC19: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | TSPAN7 | Rebecca Foulger reviewed gene: TSPAN7: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | TSHB | Rebecca Foulger reviewed gene: TSHB: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | TSEN54 | Rebecca Foulger reviewed gene: TSEN54: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | TSC2 | Rebecca Foulger reviewed gene: TSC2: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | TSC1 | Rebecca Foulger reviewed gene: TSC1: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | TRPS1 | Rebecca Foulger reviewed gene: TRPS1: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | TRPM1 | Rebecca Foulger reviewed gene: TRPM1: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | TRIP4 | Rebecca Foulger reviewed gene: TRIP4: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | TRIP13 | Rebecca Foulger reviewed gene: TRIP13: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | TRIP12 | Rebecca Foulger reviewed gene: TRIP12: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | TRIP11 | Rebecca Foulger reviewed gene: TRIP11: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | TRIM37 | Rebecca Foulger reviewed gene: TRIM37: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | TREX1 | Rebecca Foulger reviewed gene: TREX1: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | TRAPPC9 | Rebecca Foulger reviewed gene: TRAPPC9: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | TRAPPC2 | Rebecca Foulger reviewed gene: TRAPPC2: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | TRAPPC11 | Rebecca Foulger reviewed gene: TRAPPC11: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | TRAIP | Rebecca Foulger reviewed gene: TRAIP: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | TPP1 | Rebecca Foulger reviewed gene: TPP1: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | TPM3 | Rebecca Foulger reviewed gene: TPM3: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | TOE1 | Rebecca Foulger reviewed gene: TOE1: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | TNXB | Rebecca Foulger reviewed gene: TNXB: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | TNNT1 | Rebecca Foulger reviewed gene: TNNT1: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | TNNI2 | Rebecca Foulger reviewed gene: TNNI2: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | TNFRSF13B | Rebecca Foulger reviewed gene: TNFRSF13B: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | TNFRSF11B | Rebecca Foulger reviewed gene: TNFRSF11B: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | TMTC3 | Rebecca Foulger reviewed gene: TMTC3: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | TMPRSS6 | Rebecca Foulger reviewed gene: TMPRSS6: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | TMEM70 | Rebecca Foulger reviewed gene: TMEM70: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | TMEM260 | Rebecca Foulger reviewed gene: TMEM260: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | TMEM237 | Rebecca Foulger reviewed gene: TMEM237: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | TMEM231 | Rebecca Foulger reviewed gene: TMEM231: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | TMEM165 | Rebecca Foulger reviewed gene: TMEM165: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | TMEM138 | Rebecca Foulger reviewed gene: TMEM138: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | TMEM126B | Rebecca Foulger reviewed gene: TMEM126B: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | TMCO1 | Rebecca Foulger reviewed gene: TMCO1: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | TKT | Rebecca Foulger reviewed gene: TKT: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | TINF2 | Rebecca Foulger reviewed gene: TINF2: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | THRA | Rebecca Foulger reviewed gene: THRA: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | THOC6 | Rebecca Foulger reviewed gene: THOC6: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | TH | Rebecca Foulger reviewed gene: TH: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | TGM1 | Rebecca Foulger reviewed gene: TGM1: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | TGIF1 | Rebecca Foulger reviewed gene: TGIF1: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | TGFBR2 | Rebecca Foulger reviewed gene: TGFBR2: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | TGFB3 | Rebecca Foulger reviewed gene: TGFB3: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | TGDS | Rebecca Foulger reviewed gene: TGDS: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | TECPR2 | Rebecca Foulger reviewed gene: TECPR2: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | TCTN3 | Rebecca Foulger reviewed gene: TCTN3: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | TCTN2 | Rebecca Foulger reviewed gene: TCTN2: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | TCOF1 | Rebecca Foulger reviewed gene: TCOF1: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.9 | TCN2 | Rebecca Foulger reviewed gene: TCN2: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Fetal anomalies v0.3 | GNAS | Rebecca Foulger reviewed gene: GNAS: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.3 | ACADS | Rebecca Foulger reviewed gene: ACADS: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: Other - please provide details in the comments; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.3 | ABCB7 | Rebecca Foulger reviewed gene: ABCB7: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: Other - please provide details in the comments; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.3 | TMEM5 | Rebecca Foulger reviewed gene: TMEM5: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.3 | C2orf71 | Rebecca Foulger reviewed gene: C2orf71: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.3 | C4orf26 | Rebecca Foulger reviewed gene: C4orf26: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.3 | C5orf42 | Rebecca Foulger reviewed gene: C5orf42: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.3 | C21orf2 | Rebecca Foulger reviewed gene: C21orf2: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.3 | C21orf59 | Rebecca Foulger reviewed gene: C21orf59: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.3 | FAM58A | Rebecca Foulger reviewed gene: FAM58A: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: ; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.3 | MMP13 | Rebecca Foulger reviewed gene: MMP13: Rating: AMBER; Mode of pathogenicity: Other - please provide details in the comments; Publications: ; Phenotypes: ; Mode of inheritance: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fetal anomalies v0.1 | SLC25A15 |
Rebecca Foulger gene: SLC25A15 was added gene: SLC25A15 was added to Fetal anomalies. Sources: Expert Review Green,PAGE DD-Gene2Phenotype Mode of inheritance for gene: SLC25A15 was set to BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal Phenotypes for gene: SLC25A15 were set to HYPERORNITHINEMIA-HYPERAMMONEMIA-HOMOCITRULLINURIA SYNDROME |
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| Fetal anomalies v0.1 | PXDN |
Rebecca Foulger gene: PXDN was added gene: PXDN was added to Fetal anomalies. Sources: PAGE DD-Gene2Phenotype,Expert Review Amber Mode of inheritance for gene: PXDN was set to BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal Phenotypes for gene: PXDN were set to CONGENITAL CATARACT, CORNEAL OPACITY, AND DEVELOPMENTAL GLAUCOMA |
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| Fetal anomalies v0.1 | NOVA2 |
Rebecca Foulger gene: NOVA2 was added gene: NOVA2 was added to Fetal anomalies. Sources: PAGE DD-Gene2Phenotype,Expert Review Amber Mode of inheritance for gene: NOVA2 was set to MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, imprinted status unknown Phenotypes for gene: NOVA2 were set to Intellectual disability with ataxia/spasticity |
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| Fetal anomalies v0.1 | GBA2 |
Rebecca Foulger gene: GBA2 was added gene: GBA2 was added to Fetal anomalies. Sources: Expert Review Green,PAGE DD-Gene2Phenotype Mode of inheritance for gene: GBA2 was set to BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal Phenotypes for gene: GBA2 were set to AUTOSOMAL-RECESSIVE CEREBELLAR ATAXIA WITH SPASTICITY. |
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| Fetal anomalies v0.1 | EPHX1 |
Rebecca Foulger gene: EPHX1 was added gene: EPHX1 was added to Fetal anomalies. Sources: PAGE Additional Gene List,Expert Review Red Mode of inheritance for gene: EPHX1 was set to Unknown Phenotypes for gene: EPHX1 were set to Diphenylhydantoin toxicity |
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| Fetal anomalies v0.1 | DARS |
Rebecca Foulger gene: DARS was added gene: DARS was added to Fetal anomalies. Sources: Expert Review Green,PAGE DD-Gene2Phenotype Mode of inheritance for gene: DARS was set to BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal Phenotypes for gene: DARS were set to HYPOMYELINATION WITH BRAIN STEM AND SPINAL CORD INVOLVEMENT AND LEG SPASTICITY. |
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| Fetal anomalies v0.1 | CRYBA1 |
Rebecca Foulger gene: CRYBA1 was added gene: CRYBA1 was added to Fetal anomalies. Sources: Expert Review Green,PAGE DD-Gene2Phenotype Mode of inheritance for gene: CRYBA1 was set to MONOALLELIC, autosomal or pseudoautosomal, imprinted status unknown Phenotypes for gene: CRYBA1 were set to CATARACT CONGENITAL ZONULAR WITH SUTURAL OPACITIES |
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| Fetal anomalies v0.1 | CIT |
Rebecca Foulger gene: CIT was added gene: CIT was added to Fetal anomalies. Sources: PAGE DD-Gene2Phenotype,Expert Review Amber Mode of inheritance for gene: CIT was set to BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal Phenotypes for gene: CIT were set to PRIMARY MICROCEPHALY |
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| Fetal anomalies v0.1 | ASS1 |
Rebecca Foulger gene: ASS1 was added gene: ASS1 was added to Fetal anomalies. Sources: Expert Review Green,PAGE DD-Gene2Phenotype Mode of inheritance for gene: ASS1 was set to BIALLELIC, autosomal or pseudoautosomal Phenotypes for gene: ASS1 were set to CITRULLINEMIA TYPE I |
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